組織・スタッフ
- 研究部門長
- 田村具博（兼務：応用分子微生物学研究グループ長）
- 副研究部門長
-
- 鈴木 馨（兼務：生物資源情報基盤研究グループ長）
（兼務：植物機能制御研究グループ長） - 佐々木正秀（兼務：分子生物工学研究グループ長）
- 鈴木 馨（兼務：生物資源情報基盤研究グループ長）
- 首席研究員
- 深津武馬（兼務：生物共生進化機構研究グループ長）
- 総括研究主幹
- 町田雅之（兼務：応用分子微生物学研究グループ付）
- ユニット支援スタッフ
- 佐瀬 賢治 （北海道センター担当、主務：北海道センター研究業務推進室室長代理）
- 関口伸二、青木真理子、木舟千恵子、関佳奈江 （つくば第六事業所担当） 風穴 樹 （主務：総務本部 業務推進支援部）
- 名誉リサーチャー
- 北野邦尋
- 水谷文雄
- 曽良達生
- 三石 安
- 研究部門付
- 鎌形洋一（主務：生命工学領域研究戦略部長）（前研究部門長）
北海道センター
- 植物分子工学研究グループ
- 松村 健
- 田坂恭嗣
- 伊藤 亮
- 松尾幸毅
- 福澤徳穂
- 厚見 剛
- 大谷祐子
- 分子生物工学研究グループ
- 佐々木正秀（主務：副研究部門長）
- 森田直樹（主務：イノベーション推進本部総括企画主幹）
- 西宮佳志
- 坂下真実
- 山口宗宏（主務：北海道センター産学官連携推進室主幹）
- 清水弘樹
- 生体分子工学研究グループ
- 三重安弘
- 小松康雄（主務：生命工学領域研究戦略部）
- 津田 栄（不凍蛋白質特別研究チーム）
- 池上真志樹
- 近藤英昌（不凍蛋白質特別研究チーム）
- 大山恭史（不凍蛋白質特別研究チーム）
- 平野 悠
- 中村彰良
- 応用分子微生物学研究グループ
- 田村具博（主務：生物プロセス研究部門長）
- 町田雅之（兼務：生物システム工学特別研究チーム）
- 梅村舞子（主務：生命工学領域 企画主幹）
- 北川 航
- 玉野孝一
- 安武義晃
- 環境生物機能開発研究グループ
- 三谷恭雄
- 川崎公誠
- 菊池義智
- 加藤創一郎
- 伊藤英臣
- 五十嵐健輔
つくばセンター
- 生物共生進化機構研究グループ
- 深津武馬（兼務：生物プロセス研究部門 首席研究員）
- 古賀隆一
- 安佛尚志（主務：生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ）
- 沓掛磨也子（兼務：環境安全本部 安全管理部）
- 二橋 亮
- 森山 実
- 古藤日子
- 生物資源情報基盤研究グループ
- 鈴木 馨（主務：副研究部門長）
- 木村信忠（主務：環境安全本部 安全管理部）
- 玉木秀幸
- 成廣 隆
- 柿澤茂行
- 菅野 学
- 宮崎 亮
- 延 優
- 合成生物工学研究グループ
- 宮崎健太郎
- 木村和義
- 河原林 裕
- 平栗洋一（主務：評価部 総括主幹）
- 横地俊弘（主務：生命工学領域研究戦略部 パテントオフィサー）
- 植物機能制御研究グループ
- 鈴木 馨（主務：副研究部門長）
- 高木 優（招聘研究員）
- 光田展隆（主務：生命工学領域研究戦略部 企画主幹）
- 藤原すみれ
- 大島良美
- 鄭 貴美
- 中野仁美
- 坂本真吾
- バイオデザイン研究グループ
- 矢追克郎
- 藤森一浩
- 小池英明（主務：イノベーション推進本部総括主幹）
- 佐原健彦
- 奥田徹哉
- 松沢 智彦
- 末永 光（主務：創薬基盤研究部門最先端バイオ技術探求グループ）
- 研究部門付
- 星野 保（主務：イノベーション推進本部 連携主幹）
- 湯本 勳（主務：臨海副都心センター 所長代理）
- 鶴岡直樹（主務：生命工学領域研究戦略部研究企画室 企画主幹）
- ※退職・異動
- 山岡正和（平成25年3月定年退職、イノベーション推進本部国際部）
- 安田奈保美（平成25年10月異動、企画本部研究戦略室職員）
- 相羽誠一（平成26年3月定年退職、安全管理部）
- 澤田美智子（平成26年3月定年退職、消費者庁）
- 中島信孝（平成26年3月退職、東京工業大学生命理工学研究科）
- 千葉靖典（平成26年4月異動、糖鎖創薬技術研究センター）
- 松野裕樹（平成27年1月辞職）
- 榎本 賢（平成27年3月退職、東北大学）
- 亀山昭彦（平成27年4月異動、創薬基盤研究部門糖鎖レクチン工学研究グループ）
- 横尾岳彦（平成27年4月異動、創薬基盤研究部門糖鎖技術研究グループ）
- 小島 直（平成27年4月異動、バイオメディカル研究部門ナノバイオデバイス研究グループ）
- 安野理恵（平成27年4月異動、バイオメディカル研究部門健康維持機能物質開発研究グループ）
- 花田 智（平成27年9月退職、首都大学東京）
- 栗山 博（故人）
- 鈴木正昭（平成28年3月定年退職、北海道センター産学官連携推進室）
- 加我晴生（平成28年3月定年退職、北海道センター研究業務推進室）
- 植村 浩（平成28年3月定年退職、イノベーション推進本部知的財産・標準化推進部）
- 宮本恭惠（平成28年3月定年退職）
- 仲山賢一（平成28年4月異動、中国センター所長代理）
- 鶴岡直樹（平成28年4月異動、生命工学領域企画主幹）
- 横田祐司（平成29年3月定年退職）
- 神坂 泰（平成29年3月定年退職、生物プロセス研究部門バイオデザイン研究グループ）
- 扇谷 悟（平成29年3月転籍出向：国立研究開発法人日本医療研究開発機構）
平成29年4月1日
※＝グループリーダー
