研究者紹介

私は、非モデル生物、特にPyropia（ノリ）を対象に、ゲノムの配列決定、アセンブリ、アノテーションを行っています。遺伝子系統樹と種系統樹のトポロジー不一致の解析や、非モデル生物向けパイプラインを用いた遺伝子発現・機能アノテーションなどの比較トランスクリプトーム解析にも取り組んでいます。

次世代シーケンス（NGS）技術の発展により、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、プロテオミクスなどのオミクスデータが急速に蓄積されています。これらの複雑かつ高次元でノイズを含むデータから、生物学的に意味のある情報を抽出するための計算基盤の重要性が高まっています。私は、機械学習手法を活用することで、オミクスデータ内に潜在する複雑な依存関係をモデル化し、下流解析における生物学的知見の解釈性および信頼性の向上を目指しています。さらに、生体配列解析および設計を対象としたAIベースのモデリングやファインチューニング手法の研究にも取り組んでいます。これらの研究を通じて、生物機能や特性に関するAI予測の精度、制御性、ならびに実用性の向上を目指しています。