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公開DB&ツール

公開DB

ロゴマーク DB名
GlycoProtDB 糖タンパク質データベース
グライコプロテオーム解析で同定された糖タンパク質およびN型糖鎖付加部位のデータベース。
URL:https://glycosmos.org/glycoprotdb
新型コロナ関連タンパク質のNMRスペクトルのデータベース 新型コロナ関連タンパク質のNMRスペクトルのデータベース
新型コロナ関連タンパク質同士や化合物との相互作用解析などに活用可能です。
URL:https://cov2nmr.aist.go.jp/
MEDALS MEDALS
経済産業省関連ライフサイエンス統合データベースポータルサイト。
URL:https://medals.jp
LigandBox 化合物データベース LigandBox 化合物データベース
低分子化合物の3次元分子構造と原子荷電を提供するデータベース。
URL:http://www.mypresto5.com/ligandbox/cgi-bin/index.cgi?LANG=ja
toxBridge: Toxicity Bridge of drug-induced liver injury toxBridge: Toxicity Bridge of drug-induced liver injury
肝毒性に関するヒトとラット間の刻印遺伝子やパスウェイスDB。
URL:https://toxbridge.id3inst.org/top
Human Gene and Protein Database Human Gene and Protein Database(HGPD)
肝毒性に関するヒトとラット間の刻印遺伝子やパスウェイスDB。
URL:https://hgpd.lifesciencedb.jp/cgi/
肝毒性に関するヒトとラット間の刻印遺伝子やパスウェイスDB
Glycogene database Glycogene database (GGDB)
糖鎖合成に関わる遺伝子(糖鎖遺伝子)を収納したデータベースで、基質や酵素反応も検索可能。
URL:https://acgg.asia/db/ggdb/
Lectin frontier database Lectin frontier database (LfDB)
糖鎖研究に有用な様々なレクチンやその活性についてまとめているデータベースで、糖鎖との結合解析結果も一部収納。
URL:https://acgg.asia/db/lfdb/
Glyco-disease genes database Glyco-disease genes database (GDGDB)
糖糖鎖関連遺伝子の変異による疾患について収集したデータベース。
URL:https://acgg.asia/db/diseases/gdgdb
Pathogen adherence to carbohydrate database Pathogen adherence to carbohydrate database (PACDB)
細菌、菌類、毒素そしてウイルスなどの糖鎖結合性の情報を収集したデータベース。
URL:https://acgg.asia/db/diseases/pacdb
Lectin microarray-glycomeatlas Lectin microarray-glycomeatlas (LM-GlycomeAtlas)
レーザーマイクロダイセクション-レクチンマイクロアレイ技術により取得した組織糖鎖プロファイルのデータベース。
URL:https://glycosmos.org/lm_glycomeatlas/index

公開ツール

ロゴマーク ツール名
GRable GRable Glyco-RIDGE解析自動化ソフトウェア
質量分析による部位特異的グライコプロテオーム解析法(Glyco-RIDGE法)をウェブブラウザ上で実行できるウェブツール。
URL:https://glycosmos.org/grable
myPrestp myPresto 創薬支援ソフトウェア
医薬品開発支援の分子シミュレーションシステム。
URL:https://www.mypresto5.jp/
統合DB情報基盤サイト 統合DB情報基盤サイト
ワークフローによる解析技術基盤。
URL:http://togo.medals.jp/
toxRank: Toxicity Ranking order of drug-induced liver injury toxRank: Toxicity Ranking order of drug-induced liver injury
トキシコゲノミクスによる肝毒性類似化合物予測ツール。
URL:https://toxrank.id3inst.org/

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