*Corresponding author

書籍［査読有］

1. Iguchi A, Hongo C (Eds.). Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 2018.

   Iguchi A*, Hongo C. Introduction for This Book: General Aspects of the Coral Reefs of Japan. In: Iguchi A, Hongo C (Eds.) Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 1–16. 2018.

   Iguchi A*, Hongo C. Concluding Remarks: Future Perspectives on Coral Reef Studies of Japan – From Biology, Earth Science, and Conservation and Restoration. In: Iguchi A, Hongo C (Eds.) Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 175–176. 2018.

   この書籍は、琉球列島を中心とする日本のサンゴ礁研究の最新の知見について、生態学、遺伝学、化学、地学等の様々な視点から捉えた内容となっております。 琉球大学のウェブサイトでの紹介はこちら。

2. Suzuki A*, Iguchi A, Sakai K, Hayashi M, Nojiri Y. Succession of Ocean Acidification and its Effects on Reef-Building Corals. Coral Reefs of Eastern Asia under Anthropogenic Impacts. Takeuchi I, Yamashiro H (eds). pp. 97–112. 2023.

   この書籍は、東アジアにおける最近のサンゴ礁の変遷を概説し、造礁サンゴ類を対象とした実験研究等を踏まえて、工業化が進んだ海域におけるサンゴ礁維持・成立における新たな視点を提示しています。鈴木・井口らの分担執筆では、主に海洋酸性化と造礁サンゴ類の研究を中心に、これまでの知見について概説しました。

書籍［査読無］

1. 井口亮*・喜瀬浩輝．「3‒2 腹足類を中心とするベントスの生態─遺伝子解析によるアプローチ」．里海フィールド科学－京都の海に学ぶ人と自然の絆－．山下洋・益田玲爾・甲斐嘉晃・鈴木啓太・高橋宏司・邉見由美 編著．2022年10月．

   この書籍は、京都大学舞鶴水産実験所が、里海を舞台に人と自然の絆とその恵みを未来につなぐ方策を探るために、科学的知見を取りまとめたものです。井口・喜瀬の分担執筆では、日本海の腹足類の遺伝子解析研究を中心に、これまでの知見について概説しました。

学術雑誌に発表した原著論文［査読有・査読中］

Accepted / In press / Preprint

1. Santos MEA*, Reimer JD, Kiriukhin B, Wee HB, Mizuyama M, Kise H, Kitahara MV, Iguchi A, Dudoit A, Toonen RJ, Husnik F*. Coral microbiomes from the Atlantic and Indo-Pacific oceans have the same alpha diversity but different composition. bioRxiv.

2. Saito N*, Kise H, Nakajima Y, Iguchi A. Kuroshio Corridor: Larval dispersal networks explain geographically independent connectivity among coral habitats in Japan. Scientific Reports accepted.

3. Ota Y*, Suzumura M, Tsukasaki A, Suzuki A, Yamaoka K, Nagao M, Iguchi A, Nishijima M, Gibu K, Tamura T, Seike K, Aoki S, Nakano H, Ishida H, Yoshida T. Anaerobic oxidation of methane-associated biogeochemical signatures in sediments offshore of Kujukuri, eastern Japan: Implication for impacts of grain-size variations. Marine Geoscience and Energy Resources accepted.

4. Saito N*, Hamamoto K, Iguchi A. Stepping-stone larval dispersal networks maintain broad-scale connectivity across the Indo-West Pacific. Marine Ecology Progress Series accepted.

5. Chong F*, Soong GY, Hakim AA, Burke C, De Palmas S, Goesser F, Hsiao WCV, Kise H, Nishijima M, Iguchi A, Sommer B, Joyce D, Beger M, Reimer JD. Subtropical specialists dominate a coral range expansion front. Coral Reefs online first .

   熱帯から温帯の環境勾配に沿って、サンゴの宿主と共生藻類の多様性がどのように変化するかを調べるために、広域に分布しているハナヤサイサンゴ属の遺伝子型決定とメタバーコーディング解析を実施した。その結果、鹿児島県佐多岬（北緯30°）から北方に向かって、サンゴのハプロタイプが劇的に減少し、支配的な共生藻類の遺伝子型も顕著に変化していた。高緯度のサンゴにおける宿主と共生体の特異性から、高緯度のサンゴが熱帯性サンゴの存続を支えているとは考えにくいことが示唆された。

2026

1. Fujita J*, Kise H, Gibu K, Nishijima M, Misawa R, Iguchi A. Cryptic barriers to gene flow driven by deep-sea reproductive strategy in direct-developing pandalid shrimp. Molecular Ecology 35:e70264, 2026.

   少数の大型卵の生殖様式を持つ、日本海の深海域に生息するヒゴロモエビとその近縁種を対象に、形態観察と一塩基多型も含めた遺伝子解析による統合解析を行った。その結果、深海適応が幼生の分散減少、遺伝的分化増大、形態的分化を伴う異所的種分化をもたらしうることが示唆された。

2. Fujitani T, Ena S, Hosoya T, Lee S, Nishijima M, Iguchi A, Nakano H, Iwasaki N*. Multiple approaches to meso- and macroplastics and the food habitat of the green turtle, Chelonia mydas, in the Ogasawara Islands, Japan. PeerJ 14:e20425, 2026.

   小笠原に回遊するアオウミガメのプラスチック汚染の実態を解明するために、消化管内容物の顕微鏡観察、遺伝子解析、炭素及び窒素安定同位体比分析の3手法を用いて調べた。その結果、多くの個体の消化管にプラスチックが存在し、主な餌である海藻に混在するプラスチックを摂取、または餌のクラゲ類などと誤認していると考えられた。産総研からのプレスリリース記事はこちら。立正大学からのプレスリリースはこちら。日テレNEWS NNN。環境ビジネスオンライン。日刊工業新聞。環境新聞。つくばサイエンスニュース。毎日新聞。

3. Sugiura S, Taniguchi M, Kakei T, Ohtani Y, Hayashi Y, Hisatsune K, Asano T, Eguchi S, Iguchi A, Zaitsu K*. Brain metabolomics and bioinformatics analysis of a lipopolysaccharide (LPS)-induced acute inflammation model mouse reveal region-specific metabolic alterations and identify potential biomarkers of neuroinflammation. Journal of Proteome Research 25:66–74, 2026.

   リポポリサッカライドで誘導した急性炎症モデルマウスの大脳、海馬、視床下部、小脳について各脳領域の代謝物解析を実施した。その結果、炎症モデルマウスでは大脳特異的に代謝異常が生じ、N-アセチルアスパラギン酸の低下、アスパラギン酸代謝経路および尿素回路の異常、尿素の異常蓄積が明らかとなった。近畿大学からのプレスリリース記事はこちら。

4. Ishida H*, Seo E, Mukai R, Ikeuchi E, Kise H, Nishijima M, Iguchi A, Suzuki A, Tsukasaki A, Suzumura M. Growth, respiration rates and water temperature tolerance under the rearing of amphipod (Pseudorchomene sp.) collected from deep-sea floor in the Sea of Japan. Regional Studies in Marine Science 93:104656, 2026.

   日本海の深海域から採取された深海性端脚類（Pseudorchomene sp.）の飼育実験を数年に渡り実施した。その結果、最初の成熟サイズ（17 mm）への成長には約1000日と12回の脱皮を要し、寿命は6年以上であると推定された。

2025

1. Mizusawa N*, Iijima M, Iguchi A, Yasumoto J, Yasumoto-Hirose M, Abe R, Takahashi A, Ozeki T, Moriyasu K, Yoshinare T, Kato Y, Suzuki M, Watabe S, Yasumoto K. Evaluation of the toxicity of biogenic polyamines and synthetic polyethyleneimines to aquatic animals during development from diploblastic and triploblastic lineages. Japanese Journal of Environmental Toxicology 28:21–32, 2025.

   ポリアミンの水生生物への影響を評価するため、3種類のポリアミンと分子量の異なるポリエチレンイミンを用いて、サンゴ・ゼブラフィッシュ・モノアラガイ・ウニを用いたばく露実験を行った。 ポリアミンの影響は生物種間で異なる傾向を示し、生物種特異的な環境毒性リスク評価を実施することの重要性が示された。

2. Hongo C*, Iguchi A, Kiguchi M. Wave height reduction by coral growth under increased wave heights due to sea level rise and tropical cyclones in the Ryukyu Islands and the main island of Japan by 2100. Galaxea, Journal of the Coral Reef Studies 27:180-196, 2025.

   サンゴの沿岸災害リスク低下機能を評価するために、サンゴ礁が発達している沖縄県と鹿児島県のサンゴと、和歌山県のようにサンゴ礁が発達していない温帯域のサンゴを想定して、地形調査と数値シミュレーションによる解析を行った。その結果、現在の和歌山県のサンゴの波高低下率が70％以上であり、沖縄県と鹿児島県のサンゴの波高低下率が80％以上であること、和歌山県串本町と沖縄県伊計島のサンゴが2100年まで継続して成長すると、成長しない場合と比較して波高低下率が増加するため、サンゴの成長が沿岸災害リスクの低下につながることが明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。和歌山県からのプレスリリースはこちら。日本経済新聞。読売新聞。

3. Yoshihara N*, Iguchi A, Nishijima M, Iijima M. Landslide deposits caused by shallow landslides alter the redox regime in forested catchments: insights from hydrochemical and microbial analyses. Journal of Hydrology 662:133960, 2025.

   2018年北海道胆振東部地震で発生した表層崩壊における山地流域の河川水質および環境DNA解析を行った。 その結果、水質と微生物コミュニティーが変化が検出され、崩壊堆積物の内部で進行する酸化還元反応が引き起こしたものと考えられた。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

4. Yamaoka K, Washburn TW, Iguchi A, Suzuki A, Ishitani T, Murakami C, Tsune A. Sediment properties in the western Clarion-Clipperton Zone, Pacific Ocean. Elementa: Science of the Anthropocene 13:00003, 2025.

   太平洋東部のクラリオン・クリッパートン（CCZ）海域における日本の探査区において、20 cm深までの粒度・化学組成・金属類を分析し、その分布パターンから金属はマンガン酸化物・ケイ酸塩・有機物に対応する3群に分類された。水銀濃度は深海盆並みだが有機物沈降が少なくフラックスは低かった。堆積物組成は東〜中部CCZと類似するが、西部では表層の強いMn濃集は見られず、最終氷期の生産・有機物フラックスの東西差が影響したと考えられた。

5. Saito N*, Kise H, Washburn TW, Ikeuchi E, Iguchi A, Kamoshida H, Suzuki A. Seamount larval dispersal networks: a potential strategy for conserving ecological connectivity from deep-sea mining. Ecological Applications 35:e70086, 2025.

   海洋鉱物資源開発の可能性がある北西太平洋の深海に分布する18の海山を対象に、浮遊幼生の分散シミュレーションを行い、海山間の生態系の連結性を可視化した。 そして分散のための経由地として重要な海山を明らかにし、それらの保全により海域全体の連結性を維持できる可能性が示唆された。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

6. Gibu K*, Kise H, Yoshioka Y, Saito N, Nakajima Y, Sakai K, Suzuki A, Yasuda N, Iguchi A. Molecular diversity of coral microbiomes shows no relationship with latitude in the western Pacific Ocean. Marine Ecology Progress Series 772:137-150, 2025.

   日本の南西諸島に位置する黒島、伊良部島、阿嘉島、沖縄島、奄美大島、種子島に沿って幅広い緯度から採取されたコユビミドリイシの褐虫藻と原核生物の群集構造をDNAメタバーコーディング解析によって調べた。 その結果、微生物の群集構造は沖縄島および種子島で顕著に異なっていたが、その他の地点では類似しており、種子島の微生物は黒潮による環境的隔離によって形成され、沖縄島の微生物は陸域負荷などの地域的要因の影響を受けている可能性が示唆された。

7. Kunishima T*, Takata K*, Nishikawa K, Gibu K, Nishijima M, Iguchi A. Genetic population structure of Japanese freshwater crab, Geothelphusa dehaani species complex (Decapoda: Potamidae) using genome-wide SNP. bioRxiv. Scientific Reports 15:23781, 2025.

   日本列島広域におけるサワガニの集団構造解析を行った。その結果、サワガニは大きく5集団に分かれること、それぞれの集団は各地での地史の影響を受けて分化し、島またぎや飛び地状などのユニークな分布パターンを示すことが明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 サカナト。 日本経済新聞。

8. Takahashi-Kariyazono S*, Iguchi A, Terai Y*. Comparative genomics of two closely related Acropora coral species with different spawning seasons reveals genomic regions possibly associated with gametogenesis. BMC Ecology and Evolution 25:88, 2025.

   サンゴの配偶子が特定の時期に成熟するメカニズムを解明するために、産卵期が月をまたいで異なる2種のAcroporaの比較ゲノム解析を行った。その結果、両種のゲノム分岐領域には60の遺伝子が存在した。その中にはmTORC1活性化因子GATOR2の構成要素の1つであるWDR59遺伝子が含まれており、配偶子成熟のタイミングの違いに関与している可能性が示唆された。

9. Saito N*, Iguchi A. Connectivity of coral reefs along the Kuroshio Current calls for transboundary conservation strategies. Ecology and Evolution 15:e72203, 2025.

   日本の八重山・宮古諸島地域のサンゴ群集の形成・維持機構を明らかにするために、海流シミュレーションによる30年間のサンゴ幼生の分散をモデル化し、サンゴ幼生の主な供給源を明らかにすることを試みた。 その結果、八重山・宮古諸島地域の大半は同じ海域の加入に由来する一方で、外部からはフィリピンや台湾から大半が加入しており、日本周辺由来の幼生加入は少ないことが示され、海流に沿ったサンゴ礁生態系間のつながりを検討する上では、国境を越えた協力が不可欠であることが浮き彫りとなった。

10. Ishida H*, Seo E, Iguchi A, Nishijima M, Ikeuchi E, Kise H, Suzuki A, Tsukasaki A, Suzumura M. Hydrogen sulfide, hypoxia, and low salinity tolerance of deep-sea amphipods (Pseudorchomene sp.) collected from the sea floor off Joetsu, Sea of Japan. Marine Pollution Bulletin 219:118340, 2025.

    本研究では、日本海の深海域から採集した端脚類の1種、Pseudorchomene sp.を用いて、硫化水素、低塩分、低酸素などの環境耐性実験を行った。本研究と並行して行われた飼育実験では、1年以上生存し脱皮を繰り返したことから、サンプリングや飼育による衰弱の影響はないことが示唆され、信頼性の高い半致死濃度の評価が可能であると考えられた。

11. Huerlimann R*, Wee HB, Santos MEA, Kise H, Mizuyama M, Dudoit A, Jamodiong E, Satoh N, Soong GY, Kurihara H, Toonen RJ, Husnik F, Iguchi A, Ravasi T, Reimer JD. Shifts in Coral Reef Holobiont Communities in the High-CO2 Marine Environment of Iōtorishima Island. bioRxiv. PLOS Climate 4:e0000665, 2025.

    太平洋域に広く分布するスナギンチャク類の1種、Palythoa tuberculosaを対象に、硫黄島においてCO2が湧出している将来の海洋酸性化のアナログサイトと、沖縄とハワイで採取されたサンプルを用いて、DNAメタバーコーディング解析による微生物群集の多様性評価を行った。その結果、CO2が湧出している地点において細菌群集などの顕著な多様性の低下が見られた。

12. Gibu K, Hamamoto K, Koeda K, Nishijima M, Kise H, Mizuyama M, Suzuki A, Aoki N, Yasuda N, Iguchi A*. Environmental DNA analysis at multiple taxonomic levels highlights geographic variation in subtropical coastal marine communities. Scientific Reports 15:20791, 2025.

    沖縄本島南部沿岸に沿って網羅的に採取した環境DNAサンプルを用いて、クロスドメインメタバーコーディング解析（原核生物、真核生物、MiFishプライマーによる魚類）を実施した。その結果、陸域負荷が大きく、裾礁が発達している西岸と広い礁湖・藻場が発達する東岸の間で、原核生物群集と魚類群集は明確に分化していた。eDNAメタバーコーディング解析によって、沿岸生物の生物多様性の評価に加えて、環境変化を捉える上でも有効であることが示唆された。

13. Hamamoto K*, Nishijima M, Gibu K, Suzuki A, Yamazaki J, Koeda K, Aoki N, Iguchi A*. Distinct community compositions of prokaryotes, eukaryotes, and fishes revealed through environmental DNA analysis at different salinities around Ishigaki Island, Okinawa, Japan. Environmental DNA 7:e70115, 2025.

    石垣島周辺の塩分濃度の異なる環境（塩分濃度0.5以上と塩分濃度0.5未満）から採取した環境DNAサンプルを用いて、クロスドメインメタバーコーディング解析（原核生物、真核生物、MiFishプライマーによる魚類）を用いて包括的に生物多様性を調査した。その結果、各塩分濃度における共有属と固有属は、すべての分類学的レベルで異なるパターンを示した。特に原核生物の群集組成は塩分濃度グループ間で明確に分離された。eDNAメタバーコーディング解析によって、石垣島の生物多様性と公衆衛生の観点からのモニタリングへの有効性が示唆された。

14. Maeda A*, Hamamoto K, Nishijima M, Iguchi A, Suzuki A. Dinoflagellate diversity of large benthic foraminifera in harsh shallow-water environments. Coral Reefs 44:1197–1209, 2025.

    サンゴ礁の重要な石灰化生物である有孔虫の1種・Amphisorus kudakajimensisの環境適応パターンを明らかにするために、DNAメタバーコーディング解析を実施した。サンプリングは沖縄県・阿嘉島周辺の水深の異なる地点で実施した。解析の結果、水深が異なると共生褐虫藻の組成は顕著に異なり、高い紫外線強度に曝される浅海の厳しい環境に適応するために、多様性の低い褐虫藻の組み合わせに収束していることが示唆された。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

15. 石田洋*・向井稜・池内絵里・喜瀬浩輝・西島美由紀・井口亮・鈴木淳・鈴村昌弘． 日本海における深海性ヨコエビ（フトヒゲソコエビ類; Pseudorchomene sp.）の捕獲と長期飼育の試み． 海の研究 34:37-53, 2025.

    日本海の深海で採取された端脚類の1種、Pseudorchomene sp.を捕獲し、長期飼育を試みた。その結果、最長で548日間、無給餌では最長141日間生存した。本種は健全性を保っての飼育が可能なため、毒性試験等の環境影響実験に利用できることが示唆された。

16. Yasumoto J, Iijima M, Iguchi A, Nakamura T, Takada R, Yasumoto-Hirose M, Iwasaki Y, Yasutaka T, Mori-Yasumoto K, Shinjo R, Yamazaki A, Mizusawa N, Ohno Y, Suzuki A, Watabe S, Yasumoto K*. Coral decline linked to exchangeable phosphate in seawater from coastal calcareous sediments, as evidenced in Sekisei lagoon, Japan. Marine Biotechnology 27:50, 2025.

    日本最大のサンゴ礁海域である石西礁湖を対象に、サンゴ群集の属別密度や白化状況、藻類被度と底質リンとの関係を解析した。その結果、ミドリイシ属サンゴなどは底質リンと有意な負の相関を示し、陸域活動の影響を受けやすいことが示された一方で、コモンサンゴ属やハマサンゴ属では有意な相関関係はなく、底質リンへの耐性が高いことが示された。また、底質リンの濃度が高い地点では、サンゴの白化率が高い傾向が見られた。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 八重山毎日新聞。 沖縄テレビ放送。

17. Hiromatsu A, Gibu K, Suzuki A, Mizuyama M, Sakai K*, Iguchi A*. Comparison of phylotypic composition of endosymbiotic dinoflagellates of a coral, Acropora digitifera among coral reefs with different seawater temperatures at Okinawa Island, Japan. Coral Reefs 44:345-351, 2025.

    サンゴ体内の共生藻類がサンゴの高温適応に関与しているかどうかを明らかにするために、琉球列島沖縄島西海岸にて、海水温度が大きく異なる2つの隣接した地域に生息するコユビミドリイシ親群体の遺伝子解析を行った。海水温の低い地域では、Cladocopium（C50aとC50c）を宿している一方で、海水温の高い地域では、C1とDurusdinium（D1およびD4）が検出され、後者の褐虫藻類が高海水温度への順応に関与している可能性が示された。

18. Iijima M*, Yasumoto K, Yasumoto J, Iguchi A, Yasumoto-Hirose M, Mori-Yasumoto K, Mizusawa N, Jimbo M, Sakai K, Suzuki A, Watabe S. Adverse effects of total phosphate load from the environment on the skeletal formation of coral juveniles. Marine Pollution Bulletin 211:117395, 2025.

    リン酸塩の負荷量がサンゴの成長に及ぼす影響を評価するために、稚サンゴを飼育する海水の量やリン酸塩濃度を変えて骨格形成量を算出した。その結果、リン酸塩濃度だけでなく負荷量（濃度×流量）が骨格形成に影響を与えることが明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 日本経済新聞。 GSJ地質ニュース。

19. Kamata M, Kitano YF, Iguchi A, Nozawa Y, Nagai S, Chen A, Wada N, Tang SL, Yamakita T, Taninaka H, Yasuda N*. Genetic divergence of Pocillopora damicornis between temperate and subtropical regions: the need to monitor hidden genetic lineage distribution with regard to migration-load risks under climate change. Bulletin of Marine Science 101:91-104, 2025.

    亜熱帯から温帯域まで幅広く見られるハナヤサイサンゴを広域で採取し、その遺伝的集団構造を調べた。その結果、亜熱帯域と温帯域の境目で顕著な集団構造の違いが見られ、平均水温やクロロフィル-a濃度、粒子状有機炭素（POC）との関連を調べた結果、平均水温が顕著に効いていることが確認された。

20. Kawase K, Nakamura Y, Wolbeck L, Takemura S, Zaitsu K, Ando T, Jinnou H, Sawada M, Nakajima C, Rydbirk R, Gokenya S, Ito A, Fujiyama H, Saito A, Iguchi A, Kratimenos P, Ishibashi N, Gallo V, Iwata O, Saitoh S, Khodosevich K, Sawamoto K*. Significance of birth in the maintenance of quiescent neural stem cells. Science Advances 11:eadn6377, 2025.

    メタボローム解析とシングルセル遺伝子発現解析等を駆使して、「出生」によって神経幹細胞に引き起こされる分子動態の解明を試みた。胎児期の神経幹細胞である放射状グリアが、出生後に静止化を獲得し、生後の神経幹細胞として維持されるためには、適切な出生のタイミングでグルタミン代謝変動が起きることが必要であることが明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 リセマム。

21. Bell T*, Iguchi A, Ohno Y, Sakai K, Yokoyama Y. Bioinformatic approach to explain how Mg from seawater may be incorporated into coral skeletons. Royal Society Open Science 12:232011, 2025.

    サンゴ骨格の微量元素に関連する遺伝子が地質学的な時間スケールでどのように進化してきたかを調べるために、ゲノム情報が利用可能なサンゴ種を対象にMgトランスポーターの進化解析を行った。 その結果、サンゴの進化パターンに応じて海水からのMg輸送の生物学的複雑性も異なることが示唆された。 東京大学からの研究紹介はこちら。

22. Shinozaki T*, Iguchi A, Nishijima M, Goto K, Fujino S. Identification of deposits from modern and ancient large tsunamis by means of environmental DNA. Scientific Reports 15:242, 2025.

    東北地方の湖底堆積物を用いて、地質学的記録から津波堆積物を同定するための環境DNAの可能性を検討した。2011年の東北沖津波によって形成された堆積物中の多様なDNA群には、海洋由来のDNAが含まれていた。紀元869年の貞観津波と先史時代（紀元前2400-2900年）の津波によって形成された堆積物を用いて、古津波イベントを認識するためのeDNAの適用性を検討した結果、津波堆積物から検出された分類群は、背景堆積物から検出された分類群とは著しく異なっており、これまで同定が困難であったイベント堆積物の起源を解明する可能性があることが示された。

2024

1. Kise H, Reimer JD, Iguchi A, Ise Y, Tsuchida S, Fujiwara Y. Parazoanthidae (Cnidaria, Zoantharia) associated with glass sponges on the Nishi-Shichito Ridge, Northwestern Pacific Ocean, with the description of a new species. ZooKeys 1221:343–362, 2024.

   北西太平洋の海山から採取された、スナギンチャク類の新種であるVitrumanthus flosculus Kise & Reimer, sp. nov.について、形態学的観察及び分子系統樹、またこの新種と近縁種Churabana kuroshioaeのミトコンドリアゲノムについて報告した。

2. Kubota A, Ohno Y, Yasumoto J, Iijima M, Suzuki M, Iguchi A, Mori-Yasumoto K, Yasumoto-Hirose M, Sakata T, Suehiro T, Nakamae K, Mizusawa N, Jimbo M, Watabe S, Yasumoto K*. The role of polyamines in pH regulation in the extracellular calcifying medium of scleractinian coral spats. Environmental Science & Technology 58:22635–22645, 2024.

   サンゴポリプの骨格形成部位である細胞外石灰化液の詳細を把握するために、共焦点レーザー顕微鏡を用いて、ポリアミントランスポーター阻害剤およびポリアミン生合成阻害剤と、pH感受性プローブであるHPTSを併用してpH変化を調べた。また、カルシウムイオンを可視化するカルセインを用いて海水から細胞外石灰化液へのカルシウム輸送経路を調べた。その結果、今回用いたサンゴポリプでは細胞間の隙間が大きく海水が容易に細胞外石灰化液に入り込むこと、骨格形成時に細胞外石灰化液のpHを上昇させていること、ポリアミン輸送体阻害剤を添加した際に細胞外石灰化液のpH上昇が有意に低下し、生体塩基を用いて細胞外石灰化液のpHを上昇させていることが示された。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 朝日新聞。 日本経済新聞。

3. Gibu K, Mizusawa N, Iijima M, Ohno Y, Yasumoto J, Yasumoto K, Iguchi A*. Polyamine impact on physiology of early stages of reef-building corals–Insights from rearing experiments and RNA-Seq analysis. Scientific Reports 14:23465, 2024.

   サンゴに対するポリアミンの影響を評価するため、ミドリイシ属サンゴの幼生と初期ポリプを用いて飼育実験と網羅的遺伝子発現解析を行い、プトレシンによる影響を評価した。その結果、プトレシン処理サンプルにおける遺伝子発現の動的な変動が明らかになり、プトレシンがリボソームおよび翻訳に関連する遺伝子の発現にも影響を及ぼす可能性が示唆された。

4. Ohno Y*, Takahashi A, Tsutsumi M, Kubota A, Iguchi A, Iijima M, Mizusawa N, Nakamura T, Suzuki A, Suzuki M, Yasumoto J, Watabe S, Sakai K, Nemoto T, Yasumoto K. Live imaging of center of calcification formation during septum development in primary polyps of Acropora digitifera. Frontiers in Marine Science 11:1406446, 2024.

   サンゴ骨格の生成過程を詳細に明らかにするために、サンゴポリプを用いて偏光顕微鏡及び走査型2光子レーザー顕微鏡による観察を行った。その結果、サンゴの隔壁形成の初期で発生する石灰化中心の形成過程の観察と、石灰化中心の発生初期における微粒子の出現とそれに続く繊維状の炭酸カルシウム結晶の成長過程の観察に成功した。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 つくばサイエンスニュース。 GSJ地質ニュース。

5. Hamamoto K*, Mizuyama M, Nishijima M, Maeda A, Gibu K, Poliseno A, Iguchi A*, Reimer JD. Diversity, Composition and Potential Roles of Sedimentary Microbial Communities in Different Coastal Substrates around Subtropical Okinawa Island, Japan. Environmental Microbiome 19:54, 2024.

   沖縄島周辺の砂底、海草藻場、サンゴが多い環境から沿岸堆積物を採取し、メタバーコーディング解析による原核生物組成の把握と機能遺伝子の推定を行った。その結果、3つの異なる環境で原核生物の組成が有意に異なること、機能遺伝子もサンゴが多い環境でサンゴの抗酸化ストレス応答に重要であるスーパーオキシドジスムターゼが多いなど特徴的であった。

6. Hamamoto K, Iguchi A*, Gibu K, Ozawa H, Kojima M, Mizuno S, Yoshioka Y, Saito N, Fujita Y*. Asymmetric patterns of genetic population structures in a mangrove whelk at the range edges. Science of the Total Environment 930:172616, 2024. K. Hamamoto and A. Iguchi contributed equally to this work.

   インド太平洋に広く分布するキバウミニナを対象に、分布中心の集団と縁辺集団の遺伝的集団構造比較を、先行研究のデータも合わせて行った。その結果、2000 km以上地理的に離れているにも関わらず遺伝的な隔離がないこと、南北の辺縁集団で歴史的な維持過程が異なっていることが示唆された。

7. Iguchi A*, Gibu K, Yorifuji M, Nishijima M, Suzuki A, Ono T, Matsumoto Y, Inoue M, Fujii M, Muraoka D, Fujita Y, Takami H. Transgenerational acclimation to acidified seawater and gene expression patterns in a sea urchin. Science of the Total Environment 930:172616, 2024.

   海洋酸性化に対する世代間応答を明らかにするために、成熟ウニを用いた二世代飼育実験を酸性化海水中で行った。馴化した親ウニ由来の幼生は、酸性化した海水中で高い生存率を示し、サイズ減少も少なかった。また、馴化した親と馴化していない親由来の幼生間で異なる遺伝子発現パターンが観察され、酸性化海水への抵抗性に関与している可能性が示唆された。

8. Manullang C*, Tarigan A, Iguchi A, Nakamura T. Intraspecific variation in response to elevated pCO2 and temperature in the branching reef coral Acropora digitifera from different habitats. Coral Reefs 43:1071–1081, 2024.

   酸性化海水と高温ストレスのサンゴへの複合影響を個体群レベルで評価するために、経験水温の異なる地点からのコユビミドリイシ集団を用いた飼育実験を実施した。その結果、石灰化速度は2つの地点で異なり、顕著な違いが観察されたのは水温が比較的低い地点の群体のみで、特にコントロールと酸性化海水処理で顕著な違いが観察された。これらの種内変動は、順化、特定の遺伝子型の影響、あるいは群体の表現型の可塑性といった要因から生じる可能性がある。

9. Iguchi A*, Nishijima M, Ikeuchi E, Yokooka H, Sugishima H, Ikeda K, Miwa R, Sekido Y, Iwasaki N, Suzumura M, Tsukasaki A, Tanaka Y, Kato S, Minatoya J, Okamoto N, Kunishima T, Ise Y, Suzuki A*. Utilizing environmental DNA and imaging to study the deep-sea fish community of Takuyo-Daigo Seamount. npj Biodiversity 3:14, 2024.

   北西太平洋の海山の一つにおいて、環境DNA手法と、画像観察で得られた結果を比較した。その結果、画像観察では捉えられない海山周辺の深海性魚種を環境DNAによって検出した。また、天然の「大量濾過装置」であるカイメン類に、海水の環境DNAと同等の深海性魚類の検出数を確認した。今回実施した手法は、海山における環境ベースラインの効率的な調査への貢献が期待される。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 鉄鋼新聞。

10. Kise H*, Saito N, Gibu K, Asato M, Kita T, Matsuzaki K, Iguchi A*. Population structure and genetic connectivity of the big blue octopus Octopus cyanea in the Ryukyu Archipelago, Japan. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 34:e4153, 2024.

    琉球列島において水産重要種であるワモンダコ集団を対象に、遺伝的集団構造解析と幼生分散シミュレーションと組み合わせた解析を実施した。その結果、八重山集団は沖縄島集団から孤立する傾向が見られたが、全体としては高い遺伝的多様性が維持されており、個体群間の頻繁な遺伝的交流が示唆された。

11. Hisatsune K, Murata T, Taniguchi M, Asano T, Ogata K, Iguchi A, Zaitsu K*. Development of a rapid-fire drug screening method by probe electrospray ionization tandem mass spectrometry for human urine (RaDPi-U). Analytical and Bioanalytical Chemistry 416:2503-2513, 2024.

    微量な尿試料から、薬物犯罪捜査において最も重要度の高い40種類の薬物を、たった3分で迅速に分析可能な手法「RaDPi-U」を開発した。簡単な3つの手順で結果が得られるため、分析に不慣れな人でも利用可能であり、薬物犯罪捜査や急性薬物中毒の薬物分析などへの貢献が期待される。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 マイナビニュース。 日本経済新聞。 MONist。

12. Iguchi A*, Hayashi M, Yorifuji M, Nishijima M, Gibu K, Kunishima T, Bell T, Suzuki A, Ono T. Whole transcriptome analysis of demersal fish eggs reveals complex responses to ocean deoxygenation and acidification. Science of the Total Environment 917:169484, 2024.

    海洋酸性化・貧酸素化の複合影響に対するシロギス卵の遺伝子発現を網羅的に評価した。遺伝子発現に対する貧酸素化の影響は海洋酸性化よりも顕著であった。貧酸素海水区では、解糖系に関与する遺伝子群の発現が増加しており、酸素欠乏によって電子伝達経路が働きにくくなった結果、解糖系を動かすことでATPの産生を補おうとしているためと考えられた。また、貧酸素と酸性化海水の複合条件区では、発現変化が対照区と類似している遺伝子も多く見られ、見かけ上緩和されていることが示された。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 環境新聞。 日刊工業新聞。 朝日新聞1。 朝日新聞2。 GSJ地質ニュース。 森林文化協会。

13. Iguchi A*, Iijima M, Mizusawa N, Ohno Y, Yasumoto K, Suzuki A, Suga S, Tanaka K, Zaitsu K*. Single-polyp metabolomics for coral health assessment. Scientific Reports 14:3369, 2024.

    微細試料の分析が可能なPESI/MS/MSを用いることで、小さなサンゴポリプ1個での内因性代謝プロファイルの取得を実現し、化学物質がサンゴの内因性代謝に及ぼす影響を迅速かつ簡便に評価可能になった。今回確立された評価手法は、人為起源物質の影響軽減に向けた代替物質探索や、成長増加・代謝促進のようなポジティブな影響評価に活用されることが期待される。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 環境ビジネスオンライン。 週刊粧業。

14. Ikeuchi E*, Iguchi A, Nakamura T, Fukami H. Seasonal variation of grazing scars on massive Porites corals in Sekisei Lagoon, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 26:3-8, 2024.

    日本最大のサンゴ礁であり、季節変動が明瞭な石西礁湖において、塊状ハマサンゴ類の深度、魚類による齧り痕の比率、光合成効率の関係を調べた。光合成効率と齧り痕の比率の頻度に季節変動があること、水温が低い時期には、光合成効率の高い群体は、光合成効率の低い群体よりも、齧り痕からの回復が速い可能性が示唆された。

15. Hamamoto K, Iguchi A*, Gibu K, Ozawa H, Fujita Y. A discovery of the northernmost population of the giant mangrove whelk Terebralia palustris (Mollusca: Gastropoda: Potamididae) on Zamami Island and its genetic variability. Plankton and Benthos Research 19:60-65, 2024.

    マングローブ域によく見られるキバウミニナは、これまで日本の宮古島から報告された個体群が本種の最北の個体群として認識されてきたが、慶良間諸島の座間味島から新たな個体群を発見し、その特徴及び遺伝的集団構造について報告した。

16. Maruyama R, Yasumoto K, Mizusawa N, Iijima M, Yasumoto-Hirose M, Iguchi A, Hermawan OR, Hosono T, Takada R, Song K-H, Shinjo R, Watabe S, Yasumoto J*. Metagenomic analysis of the microbial communities and associated network of nitrogen metabolism genes in the Ryukyu limestone aquifer. Scientific Reports 14:4356, 2024. 沖縄県南部地域の地下水の水質分析及びメタゲノム解析を実施した。 サイト間で異なる微生物群集を有していること、あるサイトでは脱窒酵素遺伝子と共に硝酸還元酵素遺伝子を持つ微生物が増加しており、硝酸還元が地下水中の硝酸性窒素の減少に関わっている可能性が示された。 琉球大学からのプレスリリース記事はこちら。

17. Ota Y*, Iguchi A, Nishijima M, Mukai R, Suzumura M, Yoshioka H, Suzuki A, Tsukasaki A, Aoyagi T, Hori T. Methane diffusion affects characteristics of benthic communities in and around microbial mat-covered sediments in the northeastern Japan Sea. Chemosphere 349:140964, 2024.

    日本海東部に位置する酒田沖のメタン湧出域における微生物マット周辺の底生大型動物群集の特徴と地球化学的パラメータとの関係を調べた。その結果、メタンの拡散は堆積物の酸化還元条件と有機物供給に影響を与えること、DNAメタバーコーディング解析により、環形動物が優占する底生生物群集は、硫化物の多い堆積物と関連していること、微生物マットの外の環境は内部よりも生物多様性が高いことが明らかとなった。

18. Maeda A*, Nishijima M, Iguchi A, Ota Y, Suzumura M, Suzuki A. Environmental DNA metabarcoding of foraminifera for biological monitoring of bottom water and sediments on the Takuyo-Daigo Seamount in the northwestern Pacific. Frontiers in Marine Science 10:1243713, 2024.

    環境DNAメタバーコーディング解析を用いて、拓洋第5海山周辺にて採取された海水および堆積物コアで同定された浮遊性および底生有孔虫群集の時間的または垂直的な変化を評価した。海水試料では、浮遊性有孔虫群集の大まかな時間的変動が見られた。底生有孔虫の系統では単孔虫類が最も多かった。検出された有孔虫の塩基配列は堆積物層が深いほど減少したが、これは生きた個体数の減少と堆積物中のDNAの劣化の両方を反映している可能性などが考えられた。

19. Kushida Y*, Kise H, Iguchi A, Fujiwara Y, Tsuchida S. Description of the fifth sea pen species that attaches to hard substrates by modifying its peduncle. Deep-Sea Research Part I 203:104212, 2024.

    日本の深海の海洋保護区から発見されたウミエラ類の1新種、Anthoptilum gnome sp. nov.について記載するとともに、そのミトコンドリアゲノム及び系統的位置についても報告した。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 GSJ地質ニュース。

2023

1. Ishida-Castañeda J*, Iguchi A, Sakai K. Changes in DNA methylation in response to heat stress and symbiotic conditions in coral primary polyps. Marine Ecology Progress Series 714:113-117, 2023.

   褐虫藻との共生と高温ストレスが、サンゴのDNAメチル化に及ぼす影響を調べるために、コユビミドリイシの初期ポリプを用いた評価を実施した。その結果、褐虫藻との共生状態では、DNAメチル化の程度が減少すること、また、高温ストレスでは共生状態でDNAメチル化の程度が増加することが明らかとなった。

2. Ishida H*, Mukai R, Ikeuchi E, Kise H, Nishijima M, Iguchi A, Suzuki A, Suzumura M. Preliminary study on the acute effects of hydrogen sulfide on Amphipoda (Lysianassoidea; Pseudorchomene sp. and Anonyx sp.) collected from deep-sea floors in the Sea of Japan. Marine Pollution Bulletin 192:115102, 2023.

   深海域のメタンハイドレート域から深海性端脚類を採取し、DNAバーコーディングでAnonyx sp.とPseudorchomene sp.として推定種を絞り込んで、硫化水素ばく露実験を行った。その中でPseudorchomene sp.は、飼育実験環境下では1年以上生息できたこと、硫化水素ばく露実験では沿岸域の端脚類より比較的高い耐性を示すことが明らかとなり、深海性生物のばく露実験系の対象として優れていることが示された。

3. Washburn TW*, Iguchi A, Yamaoka K, Nagao M, Onishi Y, Fukuhara T, Yamamoto Y, Suzuki A. Impacts of the first deep-sea seafloor massive sulfide mining excavation tests on benthic communities. Marine Ecology Progress Series 712:1-19, 2023.

   沖縄トラフで実施された熱水鉱床掘削試験における、攪乱前と攪乱後3年までの近傍の複数の観測点における埋在性底生生物の動態と環境変化との関連を調べた。潮流の方向と地形が採掘の影響の範囲に大きく影響すること、大型の大型動物相は小型の動物相よりも採掘の影響に対する抵抗力や回復力が弱い可能性が示唆された。 Feature articleに選出。

4. Manullang C, Singh T, Sakai K*, Miyagi A, Iwasaki A, Nojiri Y, Iguchi A. Separate and combined effects of elevated pCO2 and temperature on the branching reef corals Acropora digitifera and Montipora digitata. Marine Environmental Research 188:106030, 2023.

   酸性化海水と高温ストレスのサンゴへの複合影響を評価するために、コユビミドリイシとエダコモンサンゴを用いた飼育実験を実施した。その結果、2種ともに酸性化海水よりも高温ストレスに対して鋭敏ではあったが、コユビミドリイシの方がより顕著な影響を受けた。複合ストレス区では、高温ストレスの方が死亡率増加や石灰化低下の主な要因であり、その影響は両種において相加的であった。

5. Kise H*, Santos MEA, Fourreau CJL, Iguchi A, Goto R, Reimer JD. Evolutionary patterns of host switching, lifestyle mode, and the diversification history in symbiotic zoantharians. Molecular Phylogenetics and Evolution 182:107732, 2023.

   スナギンチャク類29属27種を対象に、ミトコンドリア・核DNAマーカー配列を用いた、これまでで最も包括的な分子系統解析により、宿主交換のパターンと多様化の歴史を調べた。その結果、宿主交換を繰り返しながら多様化してきたこと、新しい宿主へのコロニー形成が、スナギンチャク類の形態的・生態的特殊化を促進したことなどが示された。

6. Suda K*, Sakamoto S, Iguchi A, Tamaki H. Novel quantitative method for individual isotopomer of organic acids from 13C tracer experiments determines carbon flow in acetogenesis. Talanta 257:124328, 2023.

   酢酸生成菌の代謝反応における炭素の流れを調べるために、13Cトレーサー実験で生成する個々の酢酸およびギ酸アイソトポマーの相対量を簡便かつ正確に決定する方法を開発した。水性試料直接注入法を用いたGC-MSと最小二乗法による質量スペクトル分析によりアイソトポマーの個々の存在量を計算することが可能となり、開発した手法を、メタノールと重炭酸塩で培養した酢酸菌の炭素固定機構の研究に適用した。

7. Afzal MS, Takeuchi K, Iguchi A, Sakai K, Dirgantara D, Nakamura T*. An assessment of Ryukyu Archipelago's coral communities over a wide latitudinal range. Deep Sea Research Part II 208:105270, 2023.

   琉球列島のサンゴ群集の詳細なベースライン評価を行うために、琉球列島の6地域において、底生生物群集を比較調査を行った。全体としては、17科55属のサンゴが記録され、サンゴ群集組成の詳細把握に成功した。これらの結果は、琉球列島のサンゴ群集の現状を明らかにし、将来の生態系の変化を比較できるような、広域的な生態系のベースラインデータを提供するものである。

8. Kise H, Iguchi A*, Saito N, Yoshioka Y, Uda K, Suzuki T, Nagano AJ, Suzuki A, Iwasaki N. Genetic population structure of the precious coral Corallium japonicum in the Northwest Pacific. Frontiers in Marine Science 10:1052033, 2023. H. Kise and A. Iguchi contributed equally to this work.

   宝石珊瑚の1種であるアカサンゴの集団遺伝解析を行った結果、基本的には本研究で調べた地理的範囲では遺伝子流動が広く維持されているが、幼生分散シミュレーションと組み合わせた解析により、遺伝的に他の集団と異なるいくつかの集団が見つかり、地理的に限られた遺伝子流動が示唆された。本研究で得られた情報は、アカサンゴの保全・持続的利用を図るために必要となる、ベースラインデータとして活用されることが期待される。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

9. Wada N, Iguchi A, Urabe Y, Yoshioka Y, Abe N, Takase K, Hayashi S, Kawanabe S, Sato Y, Tang SL*, Mano N*. Microbial mat compositions and localization patterns explain the virulence of black band disease in corals. npj Biofilms and Microbiomes 9:15, 2023.

   サンゴの黒帯病（BBD）の移動速度が異なるサンプルを対象に、マイクロスケールでの表面構造、細菌組成、空間分布が異なることを明らかにした。移動速度は、BBDマット内の中間層に局在するArcobacteraceaeに属する細菌種の相対量と正の相関があり、Rhodobacteraceaeに属する細菌種の相対量とは負の相関が見られ、BBDの微生物組成が病原性の重要な決定因子であることが明らかになった。

10. Kise H*, Nishijima M, Iguchi A, Minatoya J, Yokooka H, Ise Y, Suzuki A. A new hexactinellid sponge-associated zoantharian from the northwestern Pacific Ocean. ZooKeys 1156:71–85, 2023.

    拓洋第5海山の深海域から採取された、カイメン類と共生するスナギンチャク類の新属・新種であるParachurabana shinseimaruae Kise, gen. nov. et sp. nov.について、形態学的観察及び遺伝子解析のデータを合わせて報告した。

11. Kise H, Iguchi A*, Ikegami T, Onishi Y, Goto K, Tanaka Y, Washburn TW, Nishijima M, Kunishima T, Okamoto N, Suzuki A. Genetic population structures of common scavenging species near hydrothermal vents in the Okinawa Trough. Scientific Reports 13:2348, 2023. H. Kise and A. Iguchi contributed equally to this work.

    沖縄トラフに存在する熱水噴出孔周辺で採取された海洋ベントス複数種（魚類、十脚類、端脚類）を対象とした遺伝子解析を実施した。端脚類に関しては、分子同定から複数の推定種を抽出し、個体数が多く見られたグループを絞り込んだ。そして分子集団遺伝学的解析を実施し、基本的な遺伝的多様性情報と連結性パターンの把握を行い、将来の広域での連結性解析に向けた情報基盤を固めた。

12. Singh T, Sakai K*, Ishida J, Iguchi A. Short-term improvement of heat tolerance in naturally growing Acropora corals in Okinawa. PeerJ 11:e14629, 2023.

    高温ストレスによるサンゴの耐熱性の向上可能性を野外で明らかにすることを目的として、自然生育のサンゴ群体のモニタリングを行った。高温ストレスの程度は、2016年より2017年の方が最小ながら有意に高かったが、同じ群体では2016年より白化および死滅が少なかった。また、2016年に部分死亡を起こした群体は、2016年に部分死亡を起こさなかったコロニーに比べ、2017年に高い割合で完全白化したことから、野外においても、高温ストレスによって、サンゴ共生体の耐熱性が改善された可能性が示唆された。

2022

1. Hibino Y, Iguchi A, Zaitsu K*. Preliminary study to classify mechanisms of mitochondrial toxicity by in vitro metabolomics and bioinformatics. Toxicology and Applied Pharmacology 457:116316, 2022.

   ヒト肝がん由来細胞株のHepG2細胞に、毒性機序が異なるミトコンドリア毒性化合物を曝露してメタボローム解析を行い、得られた多変量データ解析を実施した。その結果、ミトコンドリア毒性の機序を判別する指標分子を特定することに成功し、創薬研究における医薬品の新たな毒性評価法確立への応用が期待される。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 日刊工業新聞。 日経バイオテク。

2. Kitade S, Endo N, Nogata Y, Matsumura K, Yasumoto K, Iguchi A, Yorisue T*. Faint chemical traces of conspecifics delay settlement of barnacle larvae. Frontiers in Marine Science 9:983389, 2022.

   フジツボのキプリス幼生の着生を誘起する化学物質の一つとして知られる、海水溶存性着生誘起フェロモン（WSP）の濃度による効果を調べるために、タテジマフジツボを対象とした実験を行った。その結果、WSPは、低濃度では着生を誘起せず、着生を抑制する働きを持つことを明らかとなった。低濃度のWSP刺激はキプリス幼生にとって、同種個体が存在する生息に適した着生場所が比較的離れた場所に確実に存在するという情報となり、着生場所の探索を継続させていると考えられた。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

3. Kushida Y*, Imahara Y, Wee HB, Fernandez-Silva I, Fromont J, Gomez O, Wilson N, Kimura T, Tsuchida S, Fujiwara Y, Higashiji T, Nakano H, Kohtsuka H, Iguchi A, Reimer JD. Exploring the trends of adaptation and evolution of sclerites with regards to habitat depth in sea pens. PeerJ 10:e13929, 2022.

   八放サンゴ亜綱ウミエラ目における生息水深帯の変遷に伴う骨片の適応と進化の傾向を明らかにするために、浅海域から深海域に生息するウミエラ類を網羅的に採集し、形態観察・分子系統解析・祖先形質の復元解析・統計解析を実施した。その結果、ウミエラ類およびその骨片の多様化は水深と関係があることが明らかとなり、異なる環境に進出するタイミングで骨片の多様化が生じていることが明らかとなった。 プレスリリース： 琉球大学。 立正大学。 筑波大学。 JAMSTEC。

4. Gibu K, Ikeuchi E, Bell T, Nakamura T, Yoshioka Y, Suzuki A, Iguchi A*. Calcification rates of a massive and a branching coral species were unrelated to diversity of endosymbiotic dinoflagellates. Molecular Biology Reports 49:9101–9106, 2022. K. Gibu and E. Ikeuchi contributed equally to this work.

   サンゴの成長率に共生藻類の多様性がどのように影響するかを把握するために、成長率が顕著に異なる種内系統のサンプルを用いたメタバーコーディング解析を行った。その結果、今回対象としたコユビミドリイシ・ハマサンゴに関しては、褐虫藻の多様性は種間では顕著に異なったものの、種内では明瞭な変異は見られず、成長率との関連は見られなかった。

5. Kise H*, Moritaki T, Iguchi A, Reimer JD. Epizoanthidae (Hexacorallia: Zoantharia) associated with Granulifusus gastropods (Neogastropoda: Fasciolariidae) from the Indo-West Pacific. Organisms Diversity & Evolution 22:543–554, 2022.

   腹足類と共生するヤドリスナギンチャク科について、形態観察と分子系統解析を組み合わせて分類学的研究を行った。その結果、対象標本とその近縁種間の系統関係が明らかとなり、さらに北西太平洋からヤドリスナギンチャク属1種を新種記載した。

6. Ohno Y, Iguchi A*, Iijima M, Yasumoto K, Suzuki A. Coastal ecological impacts from pumice rafts. Scientific Reports 12:11187, 2022.

   小笠原諸島で集中的な海底火山噴火が発生し、その約2ヶ月後に噴火地点から西に1300km離れた琉球列島の沖縄島沿岸に未曾有の量の軽石がもたらされた。本研究では、沖縄本島北部における、海岸の砂浜、河口、サンゴ礁、マングローブ林などに大規模な軽石の浅瀬化による生態系の変化を示す初期の証拠を報告した。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 日刊工業新聞。 読売新聞。 GSJ地質ニュース。

7. Zaitsu K*, Kawakami D, Chang J, Hisatsune K, Taniguchi M, Asano T, Iguchi A*. Metabolomics and data-driven bioinformatics revealed key maternal metabolites related to fetal lethality via Di(2‐ethylhexyl)phthalate (DEHP)-exposure in pregnant mice. ACS Omega 27:23717–23726, 2022.

   健康被害が懸念されているDEHP（フタル酸ビス(2-エチルヘキシル)）の生体影響評価のために、DEHP曝露マウスと対照妊娠マウスの血清メタボローム解析を行った。血清中の169種類の代謝物を検出することに成功し、機械学習によって、DEHP曝露の16の潜在的バイオマーカーを決定できた。また、ネットワーク解析により、ニコチン酸が代謝ネットワークにおいて最も影響力のあるハブ代謝物であることが示された。

8. Iijima M, Yasumoto J, Mori-Yasumoto K, Yasumoto-Hirose M, Iguchi A, Suzuki A, Mizusawa N, Jimbo M, Watabe S, Yasumoto K*. Visualisation of phosphate in subcalicoblastic extracellular calcifying medium and on a skeleton of coral by using a novel probe, fluorescein-4-isothiocyanate-labelled alendronic acid. Marine Biotechnology 24:524–530, 2022.

   リン酸塩がサンゴ石灰化阻害をどのように引き起こすかを明らかにするために、リン酸塩の新規蛍光プローブであるFluorescein‐4‐Isothiocyanate‐Labelled Alendronic Acid (FITC-AA)を合成し、サンゴ初期ポリプを用いて検証した。その結果、リン酸塩はサンゴポリプの細胞内を通過せず、細胞間の隙間を通過し骨格表面に吸着することが明らかになった。

9. Yamakita T*, Sodeyama F, Iguchi A, Kitano YF, Teshima KM, Shimura A, Nakabayashi A, Nagai S, Nakamura T, Aizawa H, Yasuda N. Consideration of Genetic Structure in the Ecologically and Biologically Significant Marine Areas (EBSA) Criteria: A Review of Convention on Biological Diversity (CBD) Regional Workshops and A Case Study of Coral Reef Conservation Planning. Frontiers in Marine Science 9:823009, 2022.

   生物多様性条約（CBD）の生態学的または生物学的に重要な海洋地域（EBSA）の選定において、サンゴの遺伝情報を用いて検討を進めた。その結果、遺伝的指標を用いない指標では熱帯域の重要地域が多く抽出されたが、遺伝的指標を用いることで温帯域を含む重要地域が特定できることが明らかとなった。

10. Maeda A*, Kuroyanagi A, Iguchi A, Gaye B, Rixen T, Nishi H, Kawahata H. Seasonal variation of fluxes of planktic foraminiferal tests collected by a time-series sediment trap in the central Bay of Bengal during three different years. Deep-Sea Research Part I 83:103718, 2022.

    浮遊性有孔虫の群集を制御する要因と、堆積物記録における気候・海洋過程の指標としての可能性を検討するために、ベンガル湾の堆積物トラップ試料を用いて解析を行った。その結果、堆積物トラップ試料から28種の浮遊性有孔虫が検出され、群集構造とフラックスの季節性の詳細を把握することに成功した。

11. Bell T, Manullang C, Sakai K, Suzuki A, Iguchi A*. Near-future levels of pCO2 impact skeletal growth of coral primary polyps (Acropora digitifera). Galaxea, Journal of the Coral Reef Studies24:63-68, 2022.

    サンゴ一斉産卵時に得られたサンゴポリプを用いて、pCO2濃度を調整した海水（現在：約400 ppm・近未来：約600 ppm）におけるサンゴの成長量を評価した結果、近未来レベルでも石灰化が有意に低下することが確認された。

12. Bell T, Manullang C, Kumagai NH, Sakai K, Suzuki A, Iguchi A*. Calcification responses of subtropical corals to ocean acidification: a case study from Sesoko Island, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 24:63-68, 2022.

    瀬底島周辺で見られるサンゴ6種を対象に、環境条件をほぼ均一にして複数段階の酸性化海水にばく露した結果、種間差に起因すると思われる石灰化応答パターンの変異が明らかとなった。

13. Baird AH*, Edwards AJ, Guest JR, Harii S, Hatta M, Lachs L, ...Iguchi A, ...Yamazato K. A coral spawning calendar for Sesoko Station, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 24:41-49, 2022.

    これまで沖縄県・瀬底島で観察されてきたサンゴ類の産卵パターンの概要を把握するために、これまでの産卵データを統合してデータペーパーとして取りまとめた。その結果、瀬底島における大まかな分類群に対応したサンゴ産卵パターンを把握することに成功した。

2021

1. Shinzato C, Takeuchi T, Yoshioka Y, Tada I, Kanda M, Broussard C, Iguchi A, Kusakabe M, Marin F, Satoh N, Inoue M. Whole-genome sequencing highlights conservative genomic strategies of a stress-tolerant, long-lived scleractinian coral, Porites australiensis Vaughan, 1918. Genome Biology and Evolution 13:evab270, 2021.

   長い寿命と高いストレス耐性で特徴づけられるハマサンゴの遺伝的基盤を明らかにするために、その全ゲノムを解読した。その結果、他のサンゴのゲノムと同程度の品質のゲノムアセンブリと遺伝子モデルを構築することに成功し、ハマサンゴを特徴づける遺伝子群の全容を把握することに成功した。

2. Kawakami D, Tsuchiya M, Murata T, Iguchi A, Zaitsu K*. Rapid quantification of extracellular neurotransmitters in mouse brain by PESI/MS/MS and longitudinal data analysis using the R and Stan-based Bayesian state-space model. Talanta 231:122620, 2021.

   マウス脳内の細胞外神経伝達物質をPESI/MS/MSで迅速に定量し、RとStanベースのベイズ状態空間モデルを用いて経時的なデータ解析を行う新規手法を開発した。マウス線条体における細胞外のL-グルタミン酸（L-Glu）とγ-アミノ酪酸（GABA）の定量を、プローブエレクトロスプレーイオン化/タンデム質量分析法（PESI/MS/MS）とin vivo脳マイクロダイアリシスを併用することで、迅速に行うことが可能となった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。

3. Fujita J*, Drumm DT, Iguchi A, Tominaga O, Kai Y, Yamashita Y. Small vs. large eggs: comparative population connectivity and demographic history along a depth gradient in deep-sea crangonid Argis shrimps. Biological Journal of the Linnean Society 134:650-666, 2021.

   日本海を中心に採取されたArgis属を対象とした詳細な分子集団遺伝学的解析を行い、その遺伝的集団構造の把握と卵サイズによる分散能力の差異との関連について議論した。

4. Iguchi A*, Tada I, Nagano AJ, Yasuda N. Genetic structure of Pacific crown-of-thorns starfish (Acanthaster cf. solaris) in southern Japan based on genome-wide RADseq analysis. Coral Reefs 40:1379-1385, 2021.

   サンゴの捕食者として知られるオニヒトデの北限域の集団を対象に、ゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なRAD-seq解析を実施し、遺伝子流動及び遺伝的多様性の把握を行った。その結果、北限域においても遺伝子流動が頻繁に行われており、遺伝的多様性も高く保たれていることが明らかとなった。

5. Takata K, Iwase F, Iguchi A, Yuasa H, Taninaka H, Iwasaki N, Uda K, Suzuki T, Nagano AJ, Suzuki A, Nonaka M, Kikuchi T, Yasuda N*. Genome-wide SNP data revealed notable spatial genetic structure in the deep-sea precious coral Corallium japonicum. Frontiers in Marine Science 8:667481, 2021.

   宝石サンゴの1種であるアカサンゴを対象に、高知県沖にてゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なMIG-seq解析による遺伝的集団構造の把握を試みた。そして有意な集団構造を検出できる地理的範囲とそのために必要となるSNPsの把握に成功した。

6. Fujita J*, Iguchi A, Tohkairin A, Hamatsu T, Kai Y. First record of the deep-water Argis toyamaensis Yokoya, 1933 (Decapoda, Crangonidae) in the Sea of Okhotsk, based on mitochondrial DNA sequences. Crustaceana 94:507-511, 2021.

   オホーツク海で採取されたトゲザコエビを形態及びミトコンドリアDNAで精査し、その詳細について報告した。

7. Iijima M, Yasumoto J, Iguchi A, Koiso K, Ushigome S, Nakajima N, Kunieda Y, Nakamura T, Sakai K, Yasumoto-Hirose M, Mori-Yasumoto K, Mizusawa N, Amano H, Suzuki A, Jimbo M, Watabe S, Yasumoto K*. Phosphates bound to calcareous sediments hamper skeletal development of juvenile coral. Royal Society Open Science 8:201214, 2021.

   底質に含まれるリン酸塩がサンゴの石灰化に及ぼす影響を明らかにするために、沖縄島北部及び南部地域の市街地や農地に近い沿岸域の石灰質の砂を採取し、砂と共にコユビミドリイシの稚サンゴを飼育した。その結果、場所によっては砂から飼育海水に約20 µMと高濃度のリン酸塩が溶出し、稚サンゴの骨格形成を妨げることが示された。本研究により、石灰質の底質のリン酸塩・蓄積型栄養塩がサンゴの生育に負の影響を及ぼすことを明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 沖縄タイムス。 琉球新報。 日刊工業新聞。 ・日刊ケミカルニュース。 環境展望台。

8. Baird AH*, Guest JR, Edwards AJ, Bauman AG, Bouwmeester J, Mera H, ...Iguchi A, ...Yusuf S. An Indo-Pacific coral spawning database. Scientific Data 8:35, 2021.

   サンゴ最大のイベントである産卵現象の概要を把握するために、これまで世界中で観察されてきたサンゴ類の産卵データを統合し、データペーパーとして取りまとめた。今後のサンゴ産卵現象の包括的理解に向けたベースラインとしての活用が期待される。

2020

1. Manullang C, Herwindra I, Iguchi A, Miyagi A, Tanaka Y, Nojiri Y, Sakai K*. Responses of branching reef corals Acropora digitifera and Montipora digitata to elevated temperature and pCO2. PeerJ 8:e10562, 2020.

   琉球列島でよく見られるサンゴ2種、コユビミドリイシとエダコモンサンゴを対象に、高温ストレスと酸性化海水に対する生理的応答を評価した。その結果、種間で顕著な応答の違いが確認され、共生藻の遺伝子型の違いなどが関与していることが示唆された。

2. Yorisue T*, Iguchi A, Yasuda N, Yoshioka Y, Miyagi A, Mizuyama M, Fujita Y. Extensive gene flow among anchialine cave habitats in a stygobitic shrimp. Royal Society Open Science 7:191731, 2020.

   琉球列島の海底洞窟に多く見られるリュウグウモエビを対象に、ゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なMIG-seq解析による遺伝的集団構造の把握を行った。その結果、対象種が海底洞窟という非常に特異的な生息地に見られるにも関わらず、海底洞窟間で遺伝子流動が広く維持されていることが明らかとなった。

3. Yorisue T*, Iguchi A*, Yasuda N, Yoshioka Y, Sato T, Fujita Y. Evaluating the effect of overharvesting on genetic diversity and genetic population structure of the coconut crab. Scientific Reports 10:10026, 2020. T. Yorisue and A. Iguchi contributed equally to this work.

   琉球列島に広く生息し、食用にもなる大型甲殻類ヤシガニを対象に、サイズによる個体群構造と遺伝子マーカーによる遺伝的集団構造の把握を行った。その結果、島間で遺伝子流動が広く維持されている一方で、人為的影響による体サイズ減少と性比の偏りが生じていることなどが明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 環境展望台。 つくばサイエンスニュース。 沖縄タイムス。 GSJ English site。 GSJ地質ニュース。 Scientific Reports Top 100 in Ecology 2020に選出。

4. Zaitsu K*, Eguchi S, Ohara T, Kondo K, Ishii A, Tsuchihashi H, Kawamata T, Iguchi A. PiTMaP: A new analytical platform for high-throughput direct metabolome analysis by probe electrospray ionization/tandem mass spectrometry using an R software-based data pipeline. Analytical Chemistry 92:8514–8522, 2020.

   ハイスループットかつ直接メタボローム解析が可能なPESI/MS/MSと、ソフトウェアRによるデータ処理を合わせた新規の分析プラットフォーム「PiTMaP」を確立した。本プラットフォームでは、前処理操作を行うことなく、臓器などの試料から直接、エネルギー代謝に関わる72の代謝産物を2.4分でプロファイリングでき、多変量解析や有意差検定を含めたデータ解析を1分以内に処理できる。さらに、肝臓障害モデルマウスの肝臓、および悪性度が異なるヒト髄膜腫の脳試料に対してPiTMaPを適用し、その有効性を確認した。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 GSJ English site。

5. Sanmiya K*, Koja Y, Iguchi A. The cloning of cDNAs for the Heat-shock Transcription Factors HSFA1, HSFA2, and HSFA3 from Tobacco. Tropical Agriculture and Development 64:34-40, 2020.

   タバコのストレス応答に関連する新規遺伝子の抽出のために、高温ストレスばく露サンプルを用いた遺伝子クローニングを行った。その結果、熱ショック因子であるHSFA1・HSFA2・HSFA3のクローニングに成功し、その遺伝子系統関係についても把握した。

6. Iguchi A*, Nishijima M, Yoshioka Y, Miyagi A, Miwa R, Tanaka Y, Kato S, Matsui T, Igarashi Y, Okamoto N, Suzuki A. Deep-sea amphipods around cobalt-rich ferromanganese crusts: taxonomic diversity and selection of candidate species for connectivity analysis. PLoS ONE 15:e0228483, 2020.

   コバルトリッチクラスト周辺での連結性解析に用いるための端脚類の候補種を選定するために、北太平洋・南鳥島南東沖の海山から採取した標本を用いてDNAバーコーディング解析を実施した。その結果、Abyssorchomene属の1種を候補種として定めた。本種を用いてRAD-seq解析を実施し、一塩基多型での変異が十分に観察され、今後の連結性解析に使用可能であることが明らかとなった。

7. Mizuyama M*, Iguchi A, Gibu K, Iijima M, Reimer JD. Comparison of Symbiodiniaceae diversities in different members of a Palythoa species complex (Cnidaria: Anthozoa: Zoantharia) – implications for ecological adaptations to different microhabitats. PeerJ 8:e8449, 2020.

   琉球列島の潮間帯に見られるイワスナギンチャク属種群を対象に、種間での褐虫藻の遺伝子型組成の変異について調べた。 その結果、種間で褐虫藻の遺伝子型組成に偏りが見られ、各種の生息環境との関連が示唆された。

2019

1. Sakai K*, Singh T, Iguchi A. Bleaching and post-bleaching mortality of Acropora corals on a winners and losers reef in 2016. PeerJ 7:e8138, 2019.

   2016年に生じたサンゴ大規模白化現象の際に、沖縄県瀬底島周辺のモニタリングサイトにおけるミドリイシ属サンゴ123群体の変化を追跡した。その結果、白化後の生残率には種間差及び群体サイズでの差が見られた。集団内でも生き残る群体が見られたことから、比較的緩やかな高温ストレス条件下では、ストレス耐性の高い遺伝子型の群体が選抜される可能性が示唆された。

2. Zaitsu K*, Noda S, Ohara T, Murata T, Funatsu S, Ogata K, Ishii A, Iguchi A. Optimal inter-batch normalization method for GC/MS/MS-based targeted metabolomics with special attention to centrifugal concentration. Analytical and Bioanalytical Chemistry 411:6983–6994, 2019.

   マウス血漿試料を用いて、GC/MS/MSでのメタボローム解析によって得られたデータを対象に、遠心処理及びデータ補正法の影響評価を行った。その結果、遠心処理はバッチ間のデータ変動に大きな影響を及ぼすこと、また、データの補正にはTotal Intensity補正法が有効であることが示された。

3. Iguchi A*, Yoshioka Y, Forsman ZH, Knapp ISS, Toonen RJ, Hongo Y, Nagai S, Yasuda N*. RADseq population genomics confirms divergence across closely related species in blue coral (Heliopora coerulea). BMC Evolutionary Biology 19:187, 2019.

   アオサンゴ種内で見つかっているHC-A・HC-Bの2系統間の遺伝的分化パターンを、ゲノムワイドでの一塩基多型変異の把握が可能なezRAD法を用いて解析を行った。その結果、2系統がゲノムレベルでも顕著に遺伝的に異なることが明らかとなった。また、各系統に特徴的な形質と関連する候補遺伝子を絞り込み、機能遺伝子レベルでの遺伝的変異の検出にも成功した。

4. Suzuki S*, Ataka M, Djukic I, Enoki T, Fukuzawa K, Hirota M, Hishi T, Hiura T, Hoshizaki K, Ida H, Iguchi A, Iimura Y, Ise T, Tanaka K, Kina Y, Kobayashi H, Kominami Y, Kurokawa H, Kobayashi M, Matsushita M, Miyata R, Muraoka H, Nakaji T, Nakamura M, Niwa S, Noh NJ, Sato T, Seino T, Shibata H, Suzuki R, Takahashi K, Tsunoda T, Utsumi Y, Watanabe K. Harmonized data on early stage litter decomposition using tea material across Japan. Ecological Research 34:575-576, 2019.

   幅広い気候帯に属している日本列島にまたがってリター及び土壌有機物の分解速度を統一された手法で評価するために、ティーバッグを用いた手法を適用した。2012年から2016年の間に1904個のティーバッグを用いた評価を日本各地で実施し、各地域の環境データと合わせて取りまとめた。

5. Iguchi A*, Sanmiya K, Watanabe K. Identification of ALMT and MATE as aluminum tolerance candidate genes from a typical acid soil plant, Psychotria rubura (Rubiaceae). PeerJ 7:e7739, 2019.

   亜熱帯域から熱帯域にかけて広く分布し、酸性土壌に適応しているアカネ科ボチョウジ属のボチョウジ（Psychotria rubura）のトランスクリプトーム解析を行い、2万個以上の遺伝子を同定した。その中で、酸性土壌への適応に寄与していると考えられるリンゴ酸輸送体（ALMT）とクエン酸輸送体（MATE）に着目し、先行研究との比較を行った。本研究で得られたトランスクリプトームデータは、多様化が進んでいるボチョウジ属の土壌適応の詳細の解明につながることが期待される。

6. Nakabayashi A, Yamakita T, Nakamura T, Aizawa H, Kitano YF, Iguchi A, Yamano H, Nagai S, Agostini S, Teshima KM, Yasuda N*. The potential role of temperate Japanese regions as refugia for the coral Acropora hyacinthus in the face of climate change. Scientific Reports 9:1892, 2019.

   亜熱帯域から温帯域にかけて広域に生息するクシハダミドリイシの遺伝子解析を行い、サンゴの地域絶滅リスクを評価した。その結果、温帯域の一部はサンゴの絶滅リスクが低いこと、そして全てのサンゴ種が亜熱帯域から温帯域へ簡単には移動できないことが明らかとなった。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 つくばサイエンスニュース。 大学ジャーナル。 GSJ地質ニュース。

7. Aihara Y, Maruyama S, Baird AH, Iguchi A, Takahashi S*, Minagawa J*. Green fluorescence from cnidarian hosts attracts symbiotic algae. Proceedings of the National Academy of Sciences 116:2118-2123, 2019.

   サンゴの蛍光タンパク質と褐虫藻との関わりについて、室内実験、野外実験によって検証し、サンゴの蛍光タンパク質が褐虫藻を誘引することを明らかにした。褐虫藻誘引の動画はこちら。 産総研からのプレスリリース記事はこちら。 朝日新聞。 毎日新聞。 マイナビニュース。

2018

1. Kume D*, Iguchi A, Endoh H. Onset of Accelerated Muscle Deoxygenation during 20-m Shuttle Run Test in Boys. Pediatric Exercise Science 30:474-479, 2018.

   20mシャトルランの筋酸素動態の把握を子供を対象に行った。その結果、大人の場合と同様に、20mシャトルラン中に筋の脱酸素化応答が変化するポイントがあることが分かったが、変化パターンが大人と異なる場合があることも示唆された。

2. Iwasaki S*, Suzuki A, Iguchi A, Sasaki O, Kano H, Ohno Y, Enomoto K. Effect of seawater turbulence on formation of coral primary polyp skeletons. Coral Reefs 37:939-944, 2018.

   水流がサンゴ初期ポリプの成長に及ぼす影響の詳細を明らかにするために、飼育容器の振盪有り無しで褐虫藻の無いポリプの飼育を行い、X線マイクロCTを用いた形態評価を行った。その結果、水流がある方が全体的に成長が速く、骨格の枝も太くなり、水流が褐虫藻獲得前のサンゴの初期生残に影響を与える可能性が示唆された。

3. Zaitsu K*, Noda S, Iguchi A, Hayashi Y, Ohara T, Kimura Y, Koketsu Y, Kosaki T, Kusano M, Sato T, Ishikawa T, Tsuchihashi H, Suzuki K, Ishii A. Metabolome analysis of the serotonin syndrome rat model: abnormal muscular contraction is related to metabolic alterations and hyper-thermogenesis. Life Sciences 207:550-561, 2018.

   セロトニン症候群（SS）は、選択的セロトニン再取り込み阻害薬の過剰摂取等から脳内セロトニン濃度が上昇して発症するとされるが、作用機序は不明な点が多く、有用なバイオマーカーも存在しない。そこで、SSモデルラットを作成し、血漿、肝臓、腓腹筋及び骨格筋を対象に、体調変化と遺伝子発現パターンを調べるとともに、GC/MS/MSでのメタボローム解析を行った。その結果、モデル群での直腸温の上昇、腓腹筋の異常収縮による嫌気呼吸の亢進が観察され、また代謝産物ネットワークにおける相互作用の挙動等、これらの変化との関連が示唆される代謝産物の変動が見られた。

4. Taira J*, Higa I, Tsuchida E, Isomura N, Iguchi A. Neurotransmitters in hermatypic coral, Acropora spp., and its contribution to synchronous spawning during reproductive event. Biochemical and Biophysical Research Communications 501:80-84, 2018.

   サンゴの一斉産卵現象に関与する可能性のある神経伝達物質の詳細を明らかにするために、LC/MSを用いた神経伝達物質定量化手法を確立した。この手法を用いて、産卵前後や過酸化水素処理前後で神経伝達物質であるドーパミン・アドレナリン・ノルアドレナリンの変動について評価し、産卵への関与について議論した。 沖縄タイムス。

5. Kume D*, Iguchi A, Endoh H. Accelerated point of muscle deoxygenation during the 20-m shuttle-run test. Clinical Physiology and Functional Imaging 38:390-395, 2018.

   全身持久力を評価するためのフィールドテストとして幅広く実施されている20mシャトルランの筋酸素動態の把握を行った。その結果、20mシャトルラン中に筋の脱酸素化応答が加速するポイントがあること、そのポイントは運動パフォーマンスと関連性があることが明らかとなった。

6. Bell T*, Iguchi A, Suzuki A, Seki A, Yokoyama Y. Testing possible relationships between Acropora digitifera genes, seawater chemistry and skeletal elements. Geochemical Journal 52:263-272, 2018.

   サンゴの骨格内の化学成分とその組成に関与する可能性のある遺伝子群との関係を把握するために、コユビミドリイシの遺伝子データベースを参考に、各元素の代謝に関与する遺伝子数と海水中の元素組成の関係について調べた。その結果、各元素に関連する遺伝子数は特定の元素で多い傾向があったが、明確な傾向は見られず、今後遺伝子発現量も視野に入れた研究の必要性が浮き彫りとなった。

7. Gushi M, Iguchi A, Takeuchi I*. Spawning of Acropora digitifera in an aquarium as recorded by continuous interval photography using an underwater camera. Plankton and Benthos Research 13:17-20, 2018.

   琉球列島周辺で多く見られるサンゴの一種、コユビミドリイシを対象に、ワイパー式メモリー水中カメラを用いて、10分間隔でサンゴ産卵前後の画像データを取得した。得られた画像解析を行うことで、コユビミドリイシの産卵パターンの詳細を把握することに成功し、サンゴの産卵観察における本機器の有効性が示された。

8. Taira J*, Toyoshima R, Ameku N, Iguchi A, Tamaki Y. Vanillin production by biotransformation of phenolic compounds in fungus, Aspergillus luchuensis. AMB Express 8:40, 2018.

   泡盛の特徴香気成分としては主にバニリンが知られており、バニリンの生成には微生物が関わっている可能性が示唆されているが、その詳細は明らかではない。本研究では、泡盛生産の過程で使われている黒麹菌のバニリン生成機構の解明を、化学分析とゲノム解析から試みた。その結果、バニリン生成の新しい経路と関連遺伝子の詳細を把握することに成功した。 沖縄タイムス。

9. Yorisue T*, Yoshioka Y, Sakuma K, Iguchi A. Evaluating the occurrence of cryptic invasions of a rocky shore barnacle, Semibalanus cariosus, between Japan and the northeastern Pacific. Biofouling 34:183-189, 2018.

   沿岸性生物の隠蔽種の侵入の可能性について評価するために、太平洋の東西沿岸域に見られるチシマフジツボを対象とした分子集団遺伝学的解析を実施した。日本のサンプルには1971年に採取されたサンプルも含めて解析した。その結果、太平洋の東西で遺伝的分化が見られた。日本側の遺伝子型頻度に関しては、現在も過去も顕著な差は見られなかった。そのため、チシマフジツボにおいては、太平洋の東西間での交流は制限されていることが示唆された。

学術雑誌に発表した総説［査読有］*Corresponding author

1. 鈴木淳*・入江貴博・大野良和・井上麻夕里・井口亮． サンゴ骨格気候学と石灰化モデル研究の最近の進展． 地球化学．59:177‒197. 2025．

   本総説では、サンゴの白化現象、海洋酸性化、海洋ネガエミ技術の一選択肢としての海洋アルカリ度増進の取り組みといった最新のトピックを紹介することで、サンゴの骨格形成と骨格気候学に関する最近の研究の動向について述べている。

2. 塚崎あゆみ*・宮嶋佑典・青柳智・吉岡秀佳・堀知行・林正裕・石田洋・井口亮・鈴木淳・鈴村昌弘． 表層型メタンハイドレートの研究開発に係る環境影響評価． 海洋理工学会誌．29:63–67. 2025．

   本総説では、日本海での表層型メタンハイドレートの研究開発が海洋環境に与える影響について、物理的、化学的、生物学的、生態学的側面から環境影響評価を行ってきた一連の研究事例と最新状況について紹介した。

3. 堀知行*・太田雄貴・宮嶋佑典・井口亮・塚崎あゆみ・鈴木淳・鈴村昌弘・青柳智・吉岡秀佳． メタンハイドレート賦存域海底における好気・嫌気メタン酸化の共存–メタン動態と生物群集へのインパクト–． 日本微生物生態学会誌．40:3-14. 2025．

   本総説では、日本海酒田海丘の微生物マット内外、微生物マットの無い対照区の3つの表層堆積物試料を対象として，地球化学パラメーターと微生物群集を綿密に調査した研究事例について紹介した。

4. Zaitsu K*, Eguchi S, Iguchi A. Bioinformatics and data science for mass spectrometric data analysis. Medical Mass Spectrometry 7:17-25. 2023．

   本総説では、質量分析データを用いた著者らの先行研究を中心に概説し、一般的に使用されているバイオインフォマティクスやデータサイエンスのツールについても紹介し、その応用に関する今後の展望を述べた。

5. Kawahata H*, Fujita K, Iguchi A, Inoue M, Iwasaki S, Kuroyamagi A, Maeda A, Manaka T, Moriya K, Takagi H, Toyofuku T, Yoshimura T, Suzuki A. Perspective on the response of marine calcifiers to global warming and ocean acidification – Behavior of corals and foraminifera in a high CO2 world “hot house”. Progress in Earth and Planetary Science 6:5. 2019．

   本総説は、サンゴと有孔虫の地球的規模の環境変化に対する石灰化応答について、これまで著者らが実施してきた室内飼育実験、同位体分析、高解像度顕微鏡観察による成果を含めて概説した内容である。 The Most Downloaded Paper Award 2020・2022に選出。

学術雑誌に発表した資料等［査読有］*Corresponding author

1. 鈴木克明*・板木拓也・片山肇・兼子尚知・針金由美子・齋藤直輝・岩谷北斗・松井浩紀・石塚治・山﨑誠・有元純・徳田悠希・千徳明日香・池内絵里・井口亮・鈴木淳・清家弘治． トカラ列島西方海域及び屋久島南方海域の底質分布とその制御要因． 地質調査研究報告 75:223-248. 2024．

   トカラ列島西方海域および屋久島南方海域で実施した海底地質調査航海GB22-1及びGB22-2において、95地点で表層採泥、1地点で柱状採泥を実施し、得られた堆積物試料や海底写真等の底質データに対して、各種生物種の組成や環境DNA抽出などの各種分析を行って報告した。

2. 池内絵里*・鈴木克明・井口亮・鈴木淳． トカラ列島周辺の深海域における表層堆積物の微生物群集構造． 地質調査研究報告 73:323-328. 2022．

   トカラ列島近海の海洋地質調査（GB21-1）で採集された表層堆積物中の微生物群集の遺伝子解析を実施した。 その結果、多くのDNA配列がProteobacteria門のGammaproteobacteriaとAlphaproteobacteriaに属し、次にActinobacteriota門に属すること、 また、微生物群集構造は、深度帯や基質の種類によってグループ化される傾向が見られた。

3. 池内絵里*・井口亮・中村崇． 塊状ハマサンゴ群体の非白化部位に集中した魚類によるかじり取り痕． 沖縄生物学会誌 56:53-56. 2018．

   沖縄県奥武島に見られた塊状ハマサンゴ群体を1年間モニタリングした結果、 群体内に白化の回復が異なる、あるいはブダイ類によるかじり痕密度が異なる部位が混在していることが確認された。

学術雑誌に発表した総説［査読無］*Corresponding author

1. 小埜恒夫*・村岡大祐・林正裕・依藤実樹子・鈴木淳・井口亮・藤井賢彦・Patrick Bernardo Lawrence． 沿岸域における海洋酸性化と貧酸素化の複合影響評価． 沿岸海洋研究 60:85-88, 2022年8月．

   本総説では、海洋酸性化・貧酸素化複合影響飼育実験および被験個体の網羅的遺伝子発現解析、 沿岸域におけるpH・溶存酸素濃度モニタリングおよび数値モデルを用いた沿岸域pH・溶存酸素濃度の将来予測について、 現在までに行われている研究と得られた知見について紹介した。

2. 井口亮*・水山克・頼末武史・藤田喜久． 遺伝子解析による琉球列島の海底洞窟性生物群集の多様性と集団形成・維持機構に関する研究の現状と今後の課題． TAXA 46:28-33, 2019年3月．

   本総説では、海底洞窟あるいは類似環境に生息している生物種の遺伝子解析の事例を紹介しつつ、 主に群集・個体群レベルでの今後の研究課題について述べた。

3. 鈴木淳*・井口亮・酒井一彦・中村崇・藤田和彦・田中泰章・入江貴博・加藤亜記・大野良和・林正裕・山本雄三・磯野良介・諏訪遼太・井上麻夕里・野尻幸宏． 海洋酸性化がサンゴなどの石灰化生物に与える影響評価実験． 月刊海洋 50:237-246, 2018年6月．

   本総説では、これまで筆者らが行ってきた海洋酸性化プロジェクト関連の成果をまとめると同時に、 石灰化動態の詳細を把握することが可能なライブセルイメージングなど、 最新の研究手法を用いた今後の研究の方向性についても述べた。

4. 宇田幸司*・井口亮・鈴木知彦． 宝石サンゴの遺伝子研究─ミトコンドリアゲノム解析と研究動向． 生物の科学・遺伝 72:52-58, 2018年5月．

   本総説では、筆者らが宝石サンゴを対象に実施してきたミトコンドリアゲノム解析の概要について概説し、 今後の方向性として次世代シーケンサーを用いたRADseq解析やeDNA解析の有効性についても述べた。

シンポジウム・ワークショップ・招待講演等

1. 井口亮（産総研・NPセンター）． 「ネイチャーポジティブ社会への貢献を目指した産総研での環境研究の紹介」． 産学官連携SDGs環境フォーラム in 那覇．2025年9月9日． 主催：一関工業高等専門学校・共催：一般社団法人沖縄SDGs社会実装協会． 沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）．

2. 井口亮（産総研・NPセンター）． 「ネイチャーポジティブ社会への貢献を目指した産総研での環境研究―環境DNAを中心に―」． 海洋理工学会・令和7年度春季大会シンポジウム． 2025年6月12日．日本科学未来館．

3. 井口亮（産総研・地質情報）． 「沖縄島を舞台にしたサンゴ礁のローカルな環境負荷影響と環境酵素研究の紹介」． 第1回汽水域研究セミナー． 2024年12月24日．オンライン．

4. 井口亮（産総研・地質情報）． 「強いサンゴの不思議について考える～生物としてのサンゴの多様な生き様から～」． JCUEオンラインセミナー． 2024年12月4日．オンライン． ※開催報告

5. 井口亮（産総研・地質情報）． 「ネイチャーポジティブ社会への貢献を目指した産総研での環境研究ー環境DNAとサンゴー」． つくば国際会議場内覧会 特設講演会． 2024年11月20日．つくば国際会議場．

6. 井口亮（産総研・地質情報）． 「産総研におけるネイチャーテック関連技術の紹介ーサンゴと環境DNAー」． TSUKUBA CONNÉCT #68． 2024年9月20日．co-en（つくば市）． ※イベントレポート

7. 井口亮（産総研・地質情報）． 「沖縄の自然環境を舞台にしたバイオインフォマティクス研究の展開」． シンポジウム：沖縄ならではのSociety5.0実現に向けて ． 2023年8月9日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）講堂． ※シンポジウムレポート

8. 井口亮・喜瀬浩輝（産総研・地質情報）・太田雄貴（産総研・環境創生）・池内絵里・ 西島美由紀（産総研・地質情報）・石田洋（海生研究）・塚崎あゆみ・ 鈴村昌弘（産総研・環境創生）・鈴木淳（産総研・地質情報）． 「メタンハイドレート賦存域周辺の深海生物を対象とした遺伝子解析による環境研究の紹介」． Japan Geoscience Union Meeting 2023． 2023年5月21日．幕張メッセ．発表番号MIS19-02．

9. 井口亮（産総研・地質情報）． 「遺伝子解析で沖縄島沿岸の生物多様性を俯瞰し統合解析を行う先に何が見えるか」． 第39回 地質調査総合センターシンポジウム ． 2023年3月3日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）講堂．

10. 井口亮（産総研・地質情報）． 第44回（令和4年度）沖縄研究奨励賞贈呈式 ． 2023年1月25日．パシフィックホテル沖縄．

11. 井口亮（産総研・地質情報）． 「海洋生物に迫る危機を地球規模・地域規模の環境変化から読み解けるか」． 2022年度1年理数科SSH特別授業講師（環境科学）． 2023年1月12日．沖縄県立向陽高校．

12. 井口亮（産総研・地質情報）． 第38回 地質調査総合センターシンポジウム ． 「美ら海から知る美ら島の歴史～500万年間の地史を求めて～」． 2022年12月21日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー）講堂．

13. 井口亮・鈴木淳・飯島真理子（産総研・地質情報）・安元純（琉大・農）・ 中村崇（琉大理・琉大熱生研）・酒井一彦（琉大熱生研）・ 安元剛（北里大・海洋生命）・水澤奈々美（北里大・海洋生命）・ 熊谷直喜（国環研）． 「高CO2時代に対応したサンゴ礁保全に資するローカルな環境負荷の閾値設定に向けた研究」． Japan Geoscience Union Meeting 2022． 2022年5月24日．幕張メッセ．発表番号AHW24-07． ※JpGU2022 ハイライト

14. 井口亮（産総研・地質情報）． 「海洋生物に迫る危機を地球規模・地域規模の環境変化から読み解けるか」． 2021年度1年理数科SSH特別授業（環境科学）講師． 2022年1月18日．沖縄県立向陽高校・オンライン． ※報告レポート

15. 井口亮（産総研・地質情報）． 「海洋ベントス生態学のフロンティアー底質に着目してー」． 企画者：井口亮（産総研・地質情報）． 第68回生態学会シンポジウムS14 ． 2021年3月21日．オンライン大会．

16. 井口亮（産総研・地質情報）． 「多変量解析における統計解析言語Rの活用」． 名古屋大学×島津製作所 最新質量分析 Webinar ． 2021年2月17日．

17. 井口亮（産総研・地質情報）． 「地球規模・地域規模の環境変化から読み解く海洋生物に迫る危機」． 2020年度1年理数科SSH特別授業（環境科学）講師． 2020年12月8日．沖縄県立向陽高校． ※報告レポート

18. 井口亮（産総研・地質情報）・飯島真理子（産総研・地質情報）・ベル智子（グアム大学・環境）・ 西島美由紀（産総研・地質情報）・中村崇（琉大理・琉大熱生研）・ 酒井一彦（琉大熱生研）・鈴木淳（産総研・地質情報）・ 安元純（琉大・農）・水澤奈々美（北里大・海洋生命）・ 安元剛（北里大・海洋生命）・熊谷直喜（国環研）． 「地球的規模・地域的規模の環境変化がサンゴ石灰化に及ぼす影響」． 東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会 「バイオミネラリゼーションと石灰化」． 2020年11月13日．オンライン集会．

19. 井口亮（産総研・地質情報）． 「先輩からのアドバイス 研究者への道」． 向陽SSH生徒研究発表会・特別講演会． 2020年1月28日．沖縄県立向陽高校． ※報告レポート

20. 井口亮（産総研・地質情報）． 「海洋ベントスの遺伝的集団構造を俯瞰する―熱帯・亜熱帯沿岸域を中心に―」． マリンバイオテクノロジー学会「若手の会シンポジウム」． 2018年11月26日．日本大学生物資源科学部．

その他出版物

1. 井口亮・鈴木淳・依藤実樹子・國島大河・林正裕・小埜恒夫． 「海洋の酸性化と貧酸素化の複合的な要素がシロギスの卵に及ぼす影響を明らかに—気候変動が水産資源に及ぼす影響評価—」． GSJ地質ニュース Vol. 13，p. 224-226，2024．

2. 井口亮・飯島真理子・水澤奈々美・大野良和・安元剛・鈴木淳・菅駿一・田中健・財津桂． 「たった一つのサンゴポリプで代謝物解析が可能に —サンゴを調べる新たな評価手法の確立に成功—」． GSJ地質ニュース Vol. 13，p. 199-202，2024．

3. 井口亮． 「サンゴ礁研究ハイライト：Single-polyp metabolomics for coral health assessment」． 日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 102，p.4，2024．

4. 櫛田優花・喜瀬浩輝・井口亮・藤原義弘・土田真二． 「海洋保護区安永海山の岩場で新種のウミエラ類を発見 ―北西太平洋から初報告―」． GSJ地質ニュース Vol. 13，p. 95-100，2024．

5. 大野良和・井口亮・飯島真理子・安元剛・鈴木淳． 「大量の軽石漂着が沿岸生物に与える影響―軽石漂着が始まった直後の記録―」． GSJ地質ニュース Vol. 12，p. 161-165，2023．

6. 井口亮． 「第39回地質調査総合センターシンポジウム参加報告」． 日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 97，p.3，2023．

7. ISA. Regional Environmental Assessment for the Northwest Pacific Ocean. 26 October – 6 November 2020, Online workshop. Publication Date: 19 July 2022.

8. ISA. Workshop on the Development of a Regional Environmental Management Plan for the Area of the Northwest Pacific. 26 October – 6 November 2020, Online workshop. Publication Date: 18 July 2022.

9. 井口亮． 「日本生態学会シンポジウム『海洋ベントス生態学のフロンティアー底質に着目してー』開催報告」． 日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 89，p.3，2021．

10. 頼末武史・井口亮・安田仁奈・藤田喜久． 「琉球列島におけるヤシガニは人為的影響を受けているか？−集団解析によるアプローチから−」． GSJ地質ニュース Vol. 10，p. 194-197，2021．

11. 青木伸行・井口亮・田村亨・町田功・山本聡・チョン千香子． 「環境調和型産業技術研究ラボ　沿岸環境研究チームの紹介」． GSJ地質ニュース Vol. 9，p. 343-349，2020．

12. 安田仁奈・井口亮・山北剛久・中村隆志． 「和歌山以南の温帯域が準絶滅危惧種のサンゴの避難場所として機能する？温帯サンゴの遺伝的多様性評価の結果から」． GSJ地質ニュース Vol. 10，p. 257-260，2019．

13. 井口亮． 「新人紹介」． GSJ地質ニュース Vol. 6，p. 164，2018．

2017年・前職以前の業績はこちら。