研究グループ紹介

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生物データサイエンスグループ

研究概要

有用な公共データとの連携を考慮した計測データの集約化や進行中のプロジェクトによるデータ計測・共有を図り、分子プロファイルを基にしたデータ駆動型解析技術の開発、複合体構造の分子シミュレーション及びワークフロー解析基盤の構築を行い、創薬に繋がるバイオIT融合を目指しています。

生物データサイエンス研究グループ

研究課題

研究課題1:分子プロファイルによるデータサイエンス
研究担当者:福井 一彦、今井 賢一郎、鍵和田 晴美、新木 和孝

多層オミックスデータの連携・統合化を図り、疾患変異情報や発現プロファイルを基に、薬剤ー疾患ー副作用の関連性を体系的な生体ネットワークとして捉える研究に取り組んでいます。またオントロジーを用いたナレッジグラフによる知識推論へと繋がるデータ基盤の確立を目指しています。

生物データサイエンスグループ2

研究課題

研究課題2:創薬支援ソフトウェアの開発と新規標的に対する分子設計
研究担当者:本野 千恵

標的となる受容体タンパク質の立体構造・相互作用情報に基づいた医薬分子設計を目的として、標的タンパク質の分子モデリング法の開発、化合物とのドッキング計算を行ってます。
また民間企業等との共同研究を通じたインシリコスクリーニングによる医薬品候補化合物の探索と最適化解析を実施しています。

生物データサイエンスグループ3

研究課題

研究課題3:タンパク質群ネットワーク動態の解析基盤の構築
研究担当者:鍵和田 晴美、新木 和孝

細胞外部からの刺激(シグナル)の多くはリン酸化経路によって伝えられ、細胞の挙動を決定しています。本研究では、たんぱく質アレイを用いた体系的計測、その結果の評価・解釈・可視化をパッケージ化し、高度リン酸化解析のハイスループットを実現します。
また、質量分析技術の高度化によるターゲット同定や翻訳後修飾を中心とするプロテオスタシス状態の定量、ならびに複合体ダイナミクス計測技術融合による評価技術、中分子・抗体開発といったターゲット制御技術の開発を推進しています。

生物データサイエンスグループ4

研究課題

研究課題4:疾患関連変異情報を利用した新規創薬標的探索法の構築
研究担当者:今井 賢一郎、本野 千恵

疾患に関連するミスセンス変異は、タンパク質の構造上にマップすると、リガンド結合部位やタンパク質相互作用面などの機能的に重要な部位近辺でクラスターを形成する傾向があることがわかってきています。そこで、疾患に関連するミスセンス変異部位をタンパク質構造にマップし、その空間的な集合領域をガイドとして、配列情報解析、分子動力学計算などを組み合わせた変異の影響解析、アロステリック部位予測などを行うことで、新規のタンパク質機能部位、創薬標的部位を探索する方法の開発を行っています。

生物データサイエンスグループ5

研究課題

研究課題5:動的な分子認識を利用した新規医薬品・医療技術のための理論計算基盤の開発
研究担当者:福西 快文

新規創薬モダリティは、静的な立体構造に加えて、その分子運動により機能を発揮します。一方、このように動的な創薬モダリティを解析するための理論計算ツールは、いまだ十分に開発されていません。私たちは、国内40社以上の製薬・IT企業と、共同で培ってきた計算技術を、創薬ソフトウェア群myPrestoに実装し、生命活動を調整する生体分子の運動と相互認識機構を解明する理論的ツールの開発と提供を行います。

生物データサイエンスグループ6

研究課題

研究課題6:動的生体プロファイリング・実験自動化技術の開発
研究担当者:足達 俊吾、前田 史雄

質量分析やProximity Extension Assay技術、AIを用いたデータ解析により、生体や細胞の状態を俯瞰的に捉え、その特徴から未来の状態をも予想可能とする技術を開発するとともに、ウイルスの機能を活用した細胞制御技術を開発します。また、自動培養装置、自動液滴操作、双腕ロボットを利用した実験自動化技術を開発し、実験プロトコルの最適化、標準化を容易にすることで、知識集約型のライフサイエンス研究を実現します。

生物データサイエンスグループ7

メンバー

名前 役職 主な研究テーマ
福井 一彦 FUKUI Kazuhiko グループ長 ・多層オミックス解析による薬剤候補の絞り込みと層別化
・発現プロファイルを利用した毒性解析
・データ統合による知識抽出基盤の開発
福西 快文 FUKUNISHI Yoshifumi 主任研究員 ・創薬分子設計のための計算化学ソフトウェア開発
・医薬分子を中心とした生物物理化学
・中分子・低分子の膜透過・脂溶性など物性予測
本野 千恵 MOTONO Chie 主任研究員 ・分子動力学計算による疾患メカニズム解明と創薬支援
・効率的な分子動力学計算の技術開発
・創薬向けタンパク質立体構造予測手法の開発
足達 俊吾 ADACHI Shungo 主任研究員 ・質量分析を用いた、タンパク質、RNA、細胞内シグナル経路解析技術の開発
・血液のマルチオミクス解析による生体プロファイリング技術の開発
・バイオ実験自動化装置の開発
今井 賢一郎 IMAI Kenichiro 主任研究員 ・ミトコンドリアをターゲットとした創薬支援
・疾患関連変異のタンパク質構造上の分布をガイドとした新規創薬標的探索
・潜在疾患層別化マーカー探索
鍵和田 晴美 KAGIWADA Harumi 主任研究員 ・リン酸化活性プロファイリング測定系の構築
・リン酸化活性を用いた細胞応答の解析
・リン酸化活性を用いた組織を含む生体応答の解析
新木 和孝 ARAKI Kazutaka 主任研究員(AMEDへ転籍出向中) ・質量分析測定技術の高度化と応用解析
・構造・トポロジー・動態解析技術の技術融合
・生体制御中分子の機能性の高度化
今野 雅允 KONNO Masamitsu 主任研究員 ・オミクス変化を利用した疾患新規診断、治療法の開発
・エピトランスクリプトームを中心としたトランスオミクス情報を取得解析する新規技術の開発
・生体制御修飾因子の機能解明と実用化
川田 健太郎 KAWATA Kentaro 主任研究員 ・多層オミクスデータによる細胞内ネットワーク構築
・細胞分化に伴う遺伝子制御ネットワークの動的特性解析
・逐次ネットワーク制御に基づく細胞機能制御法の開発支援
前田 史雄 MAEDA Fumio 研究員 ・HSVベクターの細胞標的能の最適化
・HSVベクターを利用した細胞間輸送システムの開発
・HSVベクター利用した細胞内情報取得技術の開発

業績リスト

  • Lintuluoto, M; Abe, M; Horioka, Y; Fukunishi, Y; Tamura, H; M, Lintuluoto J.
    Investigation on substrate specificity and catalytic activity of serine protease neuropsin.
    BIOPHYS PHYSICOBIOL. 2022 Sep 22;19:e190040. doi: 10.2142/biophysico.bppb-v19.0040
  • Tirta, YK; Adachi, S; Perez, CAG; Adhitama, N; Nong, QD; Natsume, T; Kato, Y; Watanabe, H.
    CELF1 represses Doublesex1 expression via its 5 UTR in the crustacean Daphnia magna.
    PLOS ONE. 2022 Oct 14;17(10):e0275526. doi: 10.1371/journal.pone.0275526
  • Sato, R; Suzuki, K; Yasuda, Y; Suenaga, A; Fukui, K.
    RNAapt3D: RNA aptamer 3D-structural modeling database.
    BIOPHYS J. 2022 Sep 22:S0006-3495(22)00773-1. doi: 10.1016/j.bpj.2022.09.023
  • Li, S; Ikeuchi, K; Kato, M; Buschauer, R; Sugiyama, T; Adachi, S; Kusano, H; Natsume, T; Berninghausen, O; Matsuo, Y; Becker, T; Beckmann, R; Inada, T.
    Sensing of individual stalled 80S ribosomes by Fap1 for nonfunctional rRNA turnover.
    MOL CELL. 2022 Sep 15;82(18):3424-3437.e8. doi: 10.1016/j.molcel.2022.08.018
  • Kagiwada, H; Motono, C; Horimoto, K; Fukui, K.
    Phosprof: pathway analysis database of drug response based on phosphorylation activity measurements.
    DATABASE (Oxford). 2022 Aug 22;2022:baac072. doi: 10.1093/database/baac072
  • Higo, J; Kasahara, K; Bekker, GJ; Ma, B; Sakuraba, S; Iida, S; Kamiya, N; Fukuda, I; Kono, H; Fukunishi, Y; Nakamura, H.
    Fly casting with ligand sliding and orientational selection supporting complex formation of a GPCR and a middle sized flexible molecule.
    SCI REP. 2022 Aug 13;12(1):13792. doi: 10.1038/s41598-022-17920-7
  • Hirata, Y; Oda, AH; Motono, C; Shiro, M; Ohta, K.
    Imputation-free reconstructions of three-dimensional chromosome architectures in human diploid single-cells using allele-specified contacts.
    SCI REP. 2022 Jul 11;12(1):11757. doi: 10.1038/s41598-022-15038-4
  • Kose, S; Imai, K; Watanabe, A; Nakai, A; Suzuki, Y; Imamoto, N.
    Lack of Hikeshi activates HSF1 activity under normal conditions and disturbs the heat-shock response.
    LIFE SCI ALLIANCE. 2022 May 17;5(9):e202101241. doi: 10.26508/lsa.202101241
  • Maeda, F; Kato, A; Takeshima, K; Shibazaki, M; Sato, R; Shibata,T; Miyake, K; Kozuka-Hata, H; Oyama, M; Shimizu, E; Imoto, S; Miyano, S; Adachi, S; Natsume, T; Takeuchi, K; Maruzuru, Y; Koyanagi, N; Jun, A; Yasushi, K.
    Role of the Orphan Transporter SLC35E1 in the Nuclear Egress of Herpes Simplex Virus 1.
    J VIROL. 2022 Apr 27:e0030622. doi: 10.1128/jvi.00306-22
  • Santos, HJ; Hanadate, Y; Imai, K; Watanabe, H; Nozaki, T.
    Entamoeba histolytica EHD1 Is Involved in Mitosome-Endosome Contact.
    MBIO. 2022 Apr 11:e0384921. doi: 10.1128/mbio.03849-21
  • Araiso, Y; Imai, K; Endo, T.
    Role of the TOM Complex in Protein Import into Mitochondria: Structural Views.
    ANNU REV BIOCHEM. 2022 Feb 14. doi: 10.1146/annurev-biochem-032620-104527
  • Queliconi BB, Kojima W, Kimura M, Imai K, Udagawa C, Motono C, Hirokawa T, Tashiro S, Caaveiro JMM, Tsumoto K, Yamano K, Tanaka K, Matsuda N.
    Unfolding is the driving force for mitochondrial import and degradation of Parkinsons disease-related protein DJ-1.
    J CELL SCI. 2021 Oct 22:jcs.258653. doi: 10.1242/jcs.258653
  • Kimura, M; Imai, K; Morinaka, Y; Hosono-Sakuma, Y; Horton, P; Imamoto, N.
    Distinct mutations in importin-β family nucleocytoplasmic transport receptors transportin-SR and importin-13 affect specific cargo binding.
    SCI REP. 2021 Aug 2;11(1):15649. doi: 10.1038/s41598-021-94948-1
  • Motono, C; Yanagida, S; Sato, M; Hirokawa, T.
    MDContactCom: a tool to identify differences of protein molecular dynamics from two MD simulation trajectories in terms of interresidue contacts.
    BIOINFORMATICS. 2021 Jul 21:btab538. doi: 10.1093/bioinformatics/btab538
  • Kagiwada, H; Kiboku, T; Matsuo, H; Kitazawa, M; Fukui, K; Horimoto, K.
    Assessing the activation/inhibition of tyrosine kinase-related pathways with a newly developed platform.
    PROTEOMICS. 2021 Jun 21:e2000251. doi: 10.1002/pmic.202000251
  • Amemiya, T; Horimoto, K; Fukui, K.
    Application of multiple omics and network projection analyses to drug repositioning for pathogenic mosquito-borne viruses.
    SCI REP. 2021 May 12;11(1):10136. doi: 10.1038/s41598-021-89171-x
  • Kohrogi, K; Hino, S; Sakamoto, A; Anan, K; Takase, R; Araki, H; Hino, Y; Araki, K; Sato, T; Nakamura, K; Nakao, M
    LSD1 defines erythroleukemia metabolism by controlling the lineage-specific transcription factors GATA1 and C/EBP
    Blood Adv. 2021 May 11;5(9):2305-2318. doi: 10.1182/bloodadvances.2020003521
  • Ohashi, H; Watashi, K; Saso, W; Shionoya, K; Iwanami, S; Hirokawa, T; Shirai, T; Kanaya, S; Ito, Y; Kim, KS; Nomura, T; Suzuki, T; Nishioka, K; Ando, S; Ejima, K; Koizumi, Y; Tanaka, T; Aoki, S; Kuramochi, K; Suzuki, T; Hashiguchi, T; Maenaka, K; Matano, T; Muramatsu, M; Saijo, M; Aihara, K; Iwami, S; Takeda, M; McKeating, JA; Wakita, T
    Potential anti-COVID-19 agents, Cepharanthine and Nelfinavir, and their usage for combination treatment.
    ISCIENCE. 2021 Mar 26:102367. doi: 10.1016/j.isci.2021.102367
  • Koiwai K, Morohashi K, Inaba K, Ebihara K, Kojima H, Okabe T, Yoshino R, Hirokawa T, Nampo T, Fujikawa Y, Inoue H, Yumoto F, Senda T, Niwa R
    Non-steroidal inhibitors of Drosophila melanogaster steroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo
    J Pestic Sci. 2021 Feb 20;46(1):75-87. doi: 10.1584/jpestics.D20-072
  • Kojima W, Yamano K, Kosako H, Imai K, Kikuchi R, Tanaka K, Matsuda N
    Mammalian BCAS3 and C16orf70 associate with the phagophore assembly site in response to selective and non-selective autophagy.
    AUTOPHAGY. 2021 Jan 26:1-26. doi: 10.1080/15548627.2021.1874133
  • Takeda H, Tsutsumi A, Nishizawa T, Lindau C, Busto JV, Wenz LS, Ellenrieder L, Imai K, Straub SP, Mossmann W, Qiu J, Yamamori Y, Tomii K, Suzuki J, Murata T, Ogasawara S, Nureki O, Becker T, Pfanner N, Wiedemann N, Kikkawa M, Endo T
    Mitochondrial sorting and assembly machinery operates by β-barrel switching.
    NATURE. 2021 Jan 6. doi: 10.1038/s41586-020-03113-7
  • Sasaki S, Ma Y, Ishizuka T, Bao HL, Hirokawa T, Xu Y, Tera M, Nagasawa K
    Linear consecutive hexaoxazoles as G4 ligands inducing chair-type anti-parallel topology of a telomeric G-quadruplex.
    RSC ADVANCES 10 (71) 43319-43323; doi: 10.1039/d0ra09413g DEC 7
  • Imai K, Nakai K
    Tools for the Recognition of Sorting Signals and the Prediction of Subcellular Localization of Proteins From Their Amino Acid Sequences.
    FRONT GENET 2020 Nov 25;11:607812. doi: 10.3389/fgene.2020.607812. eCollection
  • Sakamoto K, Masutani T, Hirokawa T
    Generation of KS-58 as the first K-Ras(G12D)-inhibitory peptide presenting anti-cancer activity in vivo.
    SCI REP. 10(1):21671 (2020) doi: 10.1038/s41598-020-78712-5
  • Araiso Y, Imai K, Endo T
    Structural snapshot of the mitochondrial protein import gate
    FEBS J. 2020 Dec 10. doi: 10.1111/febs.15661
  • Shin WH, Kumazawa K, Imai K, Hirokawa T, Kihara D
    Current Challenges and Opportunities in Designing Protein-Protein Interaction Targeted Drugs
    Adv Appl Bioinform Chem. 2020 Nov 12;13:11-25. doi: 10.2147/AABC.S235542
  • Nguyen HN, Suzuki K, Kimura Y, Hirokawa T, Murakami-Tonami Y, Abe H
    SYNTHESIS AND BIOLOGICAL EVALUATION OF NMDI14 DERIVATIVES AS ANTI-MESOTHELIOMA AGENTS
    HETEROCYCLES 100 (2) 253-266; (2020) doi: 10.3987/COM-19-14191
  • Santos HJ, Chiba Y, Makiuchi T, Arakawa S, Murakami Y, Tomii K, Imai K, Nozaki T
    Import of Entamoeba histolytica Mitosomal ATP Sulfurylase Relies on Internal Targeting Sequences
    Microorganisms. 8(8):1229. (2020) doi: 10.3390/microorganisms8081229
  • Nakagita T, Taketani C, Narukawa M, Hirokawa T, Kobayashi T, Misaka T
    Ibuprofen, a nonsteroidal anti-inflammatory drug, is a potent inhibitor of the human sweet taste receptor
    Chem Senses. bjaa057 (2020) doi: 10.1093/chemse/bjaa057
  • Tomonari T, Sato Y, Tanaka H, Tanaka T, Fujino Y, Mitsui Y, Hirao A, Taniguchi T, Okamoto K, Sogabe M, Miyamoto H, Muguruma N, Kagiwada H, Kitazawa M, Fukui K, Horimoto K, Takayama T
    Potential use of lenvatinib for patients with unresectable hepatocellular carcinoma including after treatment with sorafenib: Real-world evidence and in vitro assessment via protein phosphorylation array
    Oncotarget. 11: 2531-2542 (2020) doi: 10.18632/oncotarget.27640
  • Manabe T, Yasuda H, Terai H, Kagiwada H, Hamamoto J, Ebisudani T, Kobayashi K, Masuzawa K, Ikemura S, Kawada I, Hayashi Y, Fukui K, Horimoto K, Fukunaga K, Soejima K
    IGF2 Autocrine-Mediated IGF1R Activation Is a Clinically Relevant Mechanism of Osimertinib Resistance in Lung Cancer
    Molecular Cancer Res. 18: 549-559 (2020) doi: 10.1158/1541-7786.MCR-19-0956
  • Koiwai K, Inaba K, Morohashi K, Enya S, Arai R, Kojima H, Okabe T, Fujikawa Y, Inoue H, Yoshino R, Hirokawa T, Kato K, Fukuzawa K, Shimada-Niwa Y, Nakamura A, Yumoto F, Senda T, Niwa R
    An integrated approach to unravel a crucial structural property required for the function of the insect steroidogenic Halloween protein Noppera-bo
    J Biol Chem. 0: 0 (2020) doi: 10.1074/jbc.RA119.011463
  • Kagamu H, Kitano S, Yamaguchi O, Yoshimura K, Horimoto K, Kitazawa M, Fukui K, Shiono A, Mouri A, Nishihara F, Miura Y, Hashimoto K, Murayama Y, Kaira K, Kobayashi K
    CD4(+) T-cell Immunity in the Peripheral Blood Correlates with Response to Anti-PD-1 Therapy
    Cancer Immunology Res. 8 8: 334-344 (2020) doi: 10.1158/2326-6066.CIR-19-0574
  • Adachi K, Yamada T, Ishizuka H, Oki M, Tsunogae S, Shimada N, Chiba O, Orihara T, Hidaka M, Hirokawa T, Odagi M, Konoki K, Yotsu-Yamashita M, Nagasawa K
    Synthesis of C12-Keto Saxitoxin Derivatives with Unusual Inhibitory Activity Against Voltage-Gated Sodium Channels
    Chemistry. 26: 2025-2033 (2020) doi: 10.1002/chem.201904184
  • Kitazawa M, Hatta T, Sasaki Y,Fukui K, Ogawa K, Fukuda E, Goshima N, Okita N, Yamada Y, Nakagama H,Natsume T, Horimoto K
    Promotion of the Warburg effect is associated with poor benefit from adjuvant chemotherapy in colorectal cancer
    Cancer Sci. 111: 658-666 (2020) doi: 10.1111/cas.14275
  • Chiba S, Ohue M, Gryniukova A, Borysko P, Zozulya S, Yasuo N, Yoshino R, Ikeda K, Shin WH, Kihara D, Iwadate M, Umeyama H, Ichikawa T, Teramoto R, Hsin KY, Gupta V, Kitano H, Sakamoto M, Higuchi A, Miura N, Yura K, Mochizuki M, Ramakrishnan C, Thangakani AM, Velmurugan D, Gromiha MM, Nakane I, Uchida N, Hakariya H, Tan M, Nakamura HK, Suzuki SD, Ito T, Kawatani M, Kudoh K, Takashina S, Yamamoto KZ, Moriwaki Y, Oda K, Kobayashi D, Okuno T, Minami S, Chikenji G, Prathipati P, Nagao C, Mohsen A, Ito M, Mizuguchi K, Honma T, Ishida T, Hirokawa T, Akiyama Y, Sekijima M
    A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 1
    Sci Rep. 9: 19585 (2019) doi: 10.1038/s41598-019-55069-y
  • Araiso Y, Tsutsumi A, Qiu J, Imai K, Shiota T, Song J, Lindau C, Wenz LS, Sakaue H, Yunoki K, Kawano S, Suzuki J, Wischnewski M, Schutze C, Ariyama H, Ando T, Becker T, Lithgow T, Wiedemann N, Pfanner N, Kikkawa M, Endo T
    Structure of the mitochondrial import gate reveals distinct preprotein paths
    Nature.575: 395-401 (2019) doi: 10.1038/s41586-019-1680-7
  • Shiba-Ishii A, Hong J, Hirokawa T, Kim Y, Nakagawa T, Sakashita S, , Sakamoto N, Kozuma Y, Sato Y, Noguchi M
    Stratifin Inhibits SCFFBW7 Formation and Blocks Ubiquitination of Oncoproteins during the Course of Lung Adenocarcinogenesis
    Clinical Cancer Res. 25: 2809-2820 (2019) doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-3631
  • Yamasaki S, Amemiya T, Yabuki Y, Horimoto K, Fukui K
    ToGo-WF: prediction of RNA tertiary structures and RNA-RNA/protein interactions using the KNIME workflow
    J. Computer-Aided Molecular Design 33: 497-507 (2019) doi: 10.1007/s10822-019-00195-y
  • Santos HJ, Imai K, Makiuchi T, Tomii K, Horton P, Nozawa A, Okada K, Tozawa Y, Nozaki T
    Novel lineage-specific transmembrane beta-barrel proteins in the endoplasmic reticulum of Entamoeba histolytica
    FEBS J. 65: 164-170 (2019) doi: 10.1111/febs.14870
  • Yamada K, Nakazawa M, Matsumoto K, Tagami U, Hirokawa T, Homma K, Mori S, Matsumoto R, Saikawa W, Kitajima S
    Unnatural Tripeptides as Potent Positive Allosteric Modulators of T1R2/T1R3
    Acs Medicinal Chemistry Letters10: 800-805 (2019) doi: 10.1021/acsmedchemlett.9b00051
  • Santos HJ, Hanadate Y, Imai K, Nozaki T
    An Entamoeba-Specific Mitosomal Membrane Protein with Potential Association to the Golgi Apparatus
    Genes 10: 10 (2019) doi: 10.3390/genes10050367
  • Shawki HH, Ishikawa-Yamauchi Y, Kawashima A, Katoh Y, Matsuda M, Al-Soudy AS, Minisy FM, Kuno A, Gulibaikelamu X, Hirokawa T, Takahashi S, Oishi H
    EFCAB2 is a novel calcium-binding protein in mouse testis and sperm
    PloS One. 14: 0 (2019) doi: 10.1371/journal.pone.0214687
  • Parasuraman P, Selvin JFA, Gromiha MM, Fukui K, Veluraja K
    Investigation on the binding specificity of Agrocybe cylindracea galectin towards alpha(2,6)-linked sialyllactose by molecular modeling and molecular dynamics simulations
    J. Carbohydrate Chemistry 250: 463-473 (2019) doi: 10.1080/07328303.2019.1631323
  • Nakagita T, Ishida A, Matsuya T, Kobayashi T, Narukawa M, Hirokawa T, Hashimoto M, Misaka T
    Structural insights into the differences among lactisole derivatives in inhibitory mechanisms against the human sweet taste receptor
    PloS One. 14: 0 (2019) doi: 10.1371/journal.pone.0213552
  • Sakaue H, Shiota T, Ishizaka N, Kawano S, Tamura Y, Tan KS, Imai K, Motono C, Hirokawa T, Taki K, Miyata N, Kuge O, Lithgow T, Endo T
    Porin Associates with Tom22 to Regulate the Mitochondrial Protein Gate Assembly
    Mol Cell. 73: 1044-1055 (2019) doi: 10.1016/j.molcel.2019.01.003
  • Yasuda S, Hayashi T, Kajiwara Y, Murata T, Kinoshita M
    Analyses based on statistical thermodynamics for large difference between thermophilic rhodopsin and xanthorhodopsin in terms of thermostability
    J. Chemical Physics 150: 10 (2019) doi: 10.1063/1.5082217
  • Amemiya T, Gromiha MM, Horimoto K, Fukui K
    Drug repositioning for dengue haemorrhagic fever by integrating multiple omics analyses
    Scientific Reports 0: 0 (2019) doi: 10.1038/s41598-018-36636-1
  • Toyoda Y, Morimoto K, Suno R, Horita S, Yamashita K, Hirata K, Sekiguchi Y, Yasuda S, Shiroishi M, Shimizu T, Urushibata Y, Kajiwara Y, Inazumi T, Hotta Y, Asada H, Nakane T, Shiimura Y, Nakagita T, Tsuge K, Yoshida S, Kuribara T, Hosoya T, Sugimoto Y, Nomura N, Sato M, Hirokawa T, Kinoshita M, Murata T, Takayama K, Yamamoto M, Narumiya S, Iwata S, Kobayashi T
    Ligand binding to human prostaglandin E receptor EP4 at the lipid-bilayer interface
    Nat Chem Biol. 15: 18-26 (2019) doi: 10.1038/s41589-018-0131-3
  • Ma Y, Iida K, Sasaki S, Hirokawa T, Heddi B, Phan AT, Nagasawa K
    Synthesis and Telomeric G-Quadruplex-Stabilizing Ability of Macrocyclic Hexaoxazoles Bearing Three Side Chains
    Molecules. 24: 0 (2019) doi: 10.3390/molecules24020263
  • Ohsawa K, Yoshida M, Izumikawa M, Takagi M, Shin-Ya K, Goshima N, Hirokawa T, Natsume T, Doi T
    Synthesis and biological evaluation of thielocin B1 analogues as protein-protein interaction inhibitors of PAC3 homodimer
    Bioorg Med Chem. 10: 185 (2018) doi: 10.1016/j.bmc.2018.11.001
  • Nagai T, Mukoyama S, Kagiwada H, Goshima N, Mizuno K
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