Biological Systems Control Team





ヒト完全長cＤＮＡクローンからGatewayエントリークローンを作製し、ヒトタンパク質発現リソースを構築しています。

現在、ヒト遺伝子の約80％をカバーするリソースが整備されており、種々のタンパク質発現クローンの作製をハイスループットに行うことが出来ます。 また、新たな発現ベクターを開発することにより、タンパク質発現の応用範囲を拡大しています。
例えば、タンパク質相互作用の検証のために、スプリット蛍光タンパク質を融合した発現ベクターを使用しています。



更に、網羅的なヒトタンパク質発現リソースを利用して、ハイスループットタンパク質発現技術を開発し、ポストゲノム研究に活用しています。 ヒトタンパク質を網羅的にインビトロで発現したヒトタンパク質のカタログとも言うべきインビトロプロテオームを活用し、創薬スクリーニング、有用抗体作製、臨床診断などに利用しています。

また、iPS細胞誘導など細胞システム制御にヒトタンパク質発現リソースを活用しています。

今後、世界的に見て他に例を見ない網羅的に集積したヒトｃDNAのリソースの活用、プロテームワイドなタンパク質発現技術を利用し、基礎研究から産業利用まで幅広く活用して行きたいと考えています。


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研究成果、論文リスト等

22,000個のヒト完全長サイズcDNAクローンから49,000個のGateway導入クローンを作成し、約20,000クローンについてのタンパク質発現、そのタンパクチップの作成に成功。

　2009年 　2008年 　2007年 　2006年

2009

Human Gene and Protein Database (HGPD): a novel database presenting a large quantity of experiment-based results in human proteomics. Nucleic Acids Res. 37(Database issue), D762-6. Yukio Maruyama, Ai Wakamatsu, Yoshifumi Kawamura, Kouichi Kimura, Jun-ichi Yamamoto, Tetsuo Nishikawa, Yasutomo Kisu, Sumio Sugano, Naoki Goshima, Takao Isogai, Nobuo Nomura.

Novel In Vitro Protein Fragment Complementation Assay Applicable to High-Throughput Screening in 1536-Well Format. Journal of Biomolecular Screening. 14(8), 970-979. Junko Hashimoto, Taku Watanabe, Tatsuya Seki, Satoshi Karasawa, Miho　Izumikawa, Tomoe Seki, Shun-ichiro Iemura, Tohru Natsume, Nobuo Nomura, Naoki Goshima, Atsushi Miyawaki, Motoki Takagi1 and Kazuo Shin-ya.

Expression of RACK1 is a novel biomarker in pulmonary adenocarcinomas. Lung Cancer　In press. Ryo Nagashio, Yuichi Sato, Toshihide Matsumoto, Taihei Kageyama, Yukitoshi Satoh, Ryuge Shinichiro, Noriyuki Masuda, Naoki Goshima, Shi-Xu Jiang, Isao Okayasu.

2008

Human protein factory for converting the transcriptome into an in vitro-expressed proteome. Nature Methods. 5(12), 1011-7. Naoki Goshima, Yoshifumi Kawamura, Akiko Fukumoto, Aya Miura, Reiko Honma, Ryohei Satoh, Ai Wakamatsu, Jun-ichi Yamamoto, Kouichi Kimura, Tetsuo Nishikawa, Taichi Andoh, Yuki Iida, Kumiko Ishikawa, Emi Ito, Naoko Kagawa, Chie Kaminaga, Kei-ichi Kanehori, Bunsei Kawakami, Kiyokazu Kenmochi, Rie Kimura, Miki Kobayashi, Toshihiro Kuroita, Hisashi Kuwayama, Yukio Maruyama, Kiyoshi Matsuo, Kazuyoshi Minami, Mariko Mitsubori, Masatoshi Mori, Riyo Morishita, Atsushi Murase, Akira Nishikawa, Shigemichi Nishikawa, Toshihiko Okamoto, Noriko Sakagami, Yutaka Sakamoto, Yukari Sasaki, Tomoe Seki, Saki Sono, Akio Sugiyama, Tsuyoshi Sumiya, Tomoko Takayama, Yukiko Takayama, Hiroyuki Takeda, Takushi Togashi, Kazuhide Yahata, Hiroko Yamada, Yuka Yanagisawa, Yaeta Endo, Fumio Imamoto, Yasutomo Kisu, Shigeo Tanaka, Takao Isogai, Jun-ichi Imai, Shinya Watanabe, Nobuo Nomura.

2007

A Novel Nuclear Export Inhibitor JBIR-02, a New Piericidin Discovered from Streptomyces sp. ML55. J Antibiot (Tokyo). 60(7), 459-62. Jun-Ya Ueda, Takushi Togashi, Susumu Matukura, Aya Nagai, Takuji Nakashima, Hisayuki Komaki, Kozue Anzai, Shigeaki Harayama, Takayuki Doi, Takashi Takahashi, Tohru Natsume, Yasutomo Kisu, Naoki Goshima, Nobuo Nomura, Motoki Takagi, Kazuo Shin-Ya.

Structural basis of the collagen-binding mode of discoidin domain receptor 2. EMBO J. 16, 17703188. Osamu Ichikawa, Masanori Osawa, Noritaka Nishida, Naoki Goshima, Nobuo Nomura, Ichio Shimada.

2006

Immobilization of diverse foreign proteins in viral polyhedra and potential application for protein microarrays. PROTEOMICS. vol.6, 54-66. Keiko Ikeda, Hiroshi Nakazawa, Ai Shimo-Oka, Kaoru Ishio,Seiji Miyata, Yoichiroh Hosokawa, Satoshi Matsumura, Hiroshi Masuhara,Serge Belloncik, Robert Alain, Naoki Goshima, Nobuo Nomura, Kenichi Morigaki, Atsushi Kawai, Toshihiro Kuroita, Bunsei Kawakami,Yaeta Endo and Hajime Mori.

Comprehensive analysis of the ICEN (Interphase Centromere Complex) components enriched in the CENP-A chromatin of human cells. Genes to Cells. 11, 673-684. Izuta H, Ikeno M, Suzuki N, Tomonaga T, Nozaki N, Obuse C, Kisu Y, Goshima N, Nomura F, Nomura N, Yoda K.

High-throughput kinase assay based on surface plasmon resonance suitable for nayive protein substrates. Anal. Biochem. 357(2), 262-271. Hiroyuki Takeda, Akiko Fukumoto, Aya Miura, Naoki Goshima, Nobuo Nomura.

Differential responses of normal human coronary artery endothelial cells against multiple cytokines comparatively assessed by gene expression profiles. FEBS Letters. 580(30), 6871-9. Aya Miura, Reiko Honma, Takushi Togashi, Yuka Yanagisawa, Emi Ito, Jun-ichi Imai, Takao Isogai, Naoki Goshima, Shinya Watanabe, Nobuo Nomura.